RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384536.1

RNU6-1241P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1241, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1241P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1241P-201ENST00000384536 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 STK32BQ9NY57 414 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 Q9UF83 564 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CLEC4EQ9ULY5 219 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 VWA3AA6NCI4 1184 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 C15orf61A6NNL5 157 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 E9PAM4 449 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PI4K2BG5E9Z4 385 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZNF195O14628 629 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TNFSF11O14788 317 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 COQ9O75208 318 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 KBTBD11O94819 623 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TGDSO95455 350 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 APBB3O95704 486 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ACTL6AO96019 429 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
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RNU6-1241P-201ENST00000384536 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
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RNU6-1241P-201ENST00000384536 RPS16P62249 146 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CDR2Q01850 454 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZNF543Q08ER8 600 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ATP1A4Q13733 1029 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP-0.68□□□□□ -2.52
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RNU6-1241P-201ENST00000384536 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 LINC00242Q5T6M2 205 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MTFR2Q6P444 385 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 KSR2Q6VAB6 950 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 KIF6Q6ZMV9 814 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 C16orf86Q6ZW13 317 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 HAUS6Q7Z4H7 955 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 OR4N4Q8N0Y3 316 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SCAIQ8N9R8 606 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CLEC4CQ8WTT0 213 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 HPSE2Q8WWQ2 592 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SLCO4A1Q96BD0 722 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 HDAC11Q96DB2 347 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 WDFY2Q96P53 400 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CGRRF1Q99675 332 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ATF6BQ99941 703 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 KATNAL1Q9BW62 490 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 AS3MTQ9HBK9 375 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SLC38A7Q9NVC3 462 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 COQ3Q9NZJ6 369 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 RAB21Q9UL25 225 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PSG11Q9UQ72 335 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ERVK-11Q9UQG0 969 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 LOC105371242A0A075B767 164 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 A0A0G2JNG1 304 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 C5orf60A6NFR6 353 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MSGN1A6NI15 193 aa-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1241P-201ENST00000384536 FAM200BP0CF97 657 aa-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1241P-201ENST00000384536 DDX5P17844 614 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SLC7A1P30825 629 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PIK3CBP42338 1070 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PAX9P55771 341 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SLC18A2Q05940 514 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GPR17Q13304 367 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CSHL1Q14406 222 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 KIR2DS5Q14953 304 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ASPRV1Q53RT3 343 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FAXCQ5TGI0 409 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 AADACL2Q6P093 401 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 UNC13DQ70J99 1090 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FMNL3Q8IVF7 1028 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 VPS52Q8N1B4 723 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 OR2T12Q8NG77 320 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 C11orf45Q8TAV5 145 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TBC1D16Q8TBP0 767 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 DYRK2Q92630 601 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TADA1Q96BN2 335 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GRAMD1AQ96CP6 724 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 C18orf8Q96DM3 657 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SLC47A1Q96FL8 570 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 LGMNQ99538 433 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
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