RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376959.6

KCNC3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene KCNC3, Length 5,447 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3-201ENST00000376959 PBX1P40424 430 aa22.17■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 CACUL1Q86Y37 369 aa22.17■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.17■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 FAM155BO75949 473 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 IL1R1P14778 569 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 ADNP2Q6IQ32 1131 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 SPOCK2Q92563 424 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 TP53INP1Q96A56 240 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 ART5Q96L15 291 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 EHD1Q9H4M9 534 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF567Q8N184 647 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 DNAJC11Q9NVH1 559 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 NUP50Q9UKX7 468 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 SSR2P43308 183 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 TLCD1Q96CP7 247 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 CYP3A7P24462 503 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 PSEN2P49810 448 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 IL23RQ5VWK5 629 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 FAM83AQ86UY5 434 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 SLC22A4Q9H015 551 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 ISM1B1AKI9 464 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 CCNB2O95067 398 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 PAX3P23760 479 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 DCDC1P59894 354 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF234Q14588 700 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 HAS1Q92839 578 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 MGME1Q9BQP7 344 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 PRELID1Q9Y255 219 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 TBL1XO60907 577 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 IFNA7P01567 189 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 MT-ND1P03886 318 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 COL6A1P12109 1028 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 MPPE1Q53F39 396 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 FAM151BQ6UXP7 276 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 TDRPQ86YL5 185 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 TMC8Q8IU68 726 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 CHST4Q8NCG5 386 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 SMURF2Q9HAU4 748 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 ASF1AQ9Y294 204 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 PGLSO95336 258 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 POMPQ9Y244 141 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 SLC22A1O15245 554 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 HCN1O60741 890 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 PKMP14618 531 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 RORCP51449 518 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 MADCAM1Q13477 382 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 FAM91A1Q658Y4 838 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 UBR7Q8N806 425 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 EFCAB9A8MZ26 197 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 XKRYO14609 159 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 CTPS1P17812 591 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 TOR3AQ9H497 397 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 HERC3Q15034 1050 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 DENND1CQ8IV53 801 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF563Q8TA94 476 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 UFD1Q92890 307 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 LHX5Q9H2C1 402 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNC3-201ENST00000376959 GATBO75879 557 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
KCNC3-201ENST00000376959 PRH1P02810 166 aa22.14■■□□□ 1.13
KCNC3-201ENST00000376959 ICAM3P32942 547 aa22.14■■□□□ 1.13
KCNC3-201ENST00000376959 TEX44Q53QW1 395 aa22.14■■□□□ 1.13
KCNC3-201ENST00000376959 FRRS1Q6ZNA5 592 aa22.14■■□□□ 1.13
KCNC3-201ENST00000376959 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.14■■□□□ 1.13
KCNC3-201ENST00000376959 C17orf64Q86WR6 236 aa22.14■■□□□ 1.13
KCNC3-201ENST00000376959 OR52J3Q8NH60 311 aa22.14■■□□□ 1.13
KCNC3-201ENST00000376959 CPT1BQ92523 772 aa22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms