RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372478.4

C9orf50-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene C9orf50, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50-201ENST00000372478 LMO7DNF2Z398 122 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 YY2O15391 372 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 DNAJC6O75061 913 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CEACAM1P13688 526 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 NPY2RP49146 381 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 SARNPP82979 210 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 TSTD2Q5T7W7 516 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 PPIL6Q8IXY8 311 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 C19orf43Q9BQ61 176 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 SYBUQ9NX95 663 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 NLGN3Q9NZ94 848 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 FTSJ1Q9UET6 329 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 DOLKQ9UPQ8 538 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 AP3B1O00203 1094 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 ANXA6P08133 673 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 NFATC2Q13469 925 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 PYCR3Q53H96 274 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 PPM1JQ5JR12 505 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 PCID2Q5JVF3 399 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 GPRC6AQ5T6X5 926 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 GALNT13Q8IUC8 556 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 MCUQ8NE86 351 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 OR13J1Q8NGT2 312 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 OR2M4Q96R27 311 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 IL22Q9GZX6 179 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CHRAC1Q9NRG0 131 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 ALPPL2P10696 532 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 MYF5P13349 255 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 IVDP26440 423 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 VSNL1P62760 191 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 LAMB3Q13751 1172 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 IZUMO3Q5VZ72 239 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 TAF8Q7Z7C8 310 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CDC6Q99741 560 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 ST14Q9Y5Y6 855 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 OR51F1A6NGY5 319 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 H7C0S8 307 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 NUAK1O60285 661 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 PRSS56P0CW18 603 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 ITGALP20701 1170 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 PSMA3P25788 255 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 AK4P27144 223 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 MAP9Q49MG5 647 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 GKN2Q86XP6 184 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 MPP5Q8N3R9 675 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 DDHD1Q8NEL9 900 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 SERPINB12Q96P63 405 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 ERP44Q9BS26 406 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 SMOXQ9NWM0 555 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CCDC162PA2VCL2 907 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CDK14O94921 469 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 TNFRSF8P28908 595 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CTBSQ01459 385 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 LDLRAP1Q5SW96 308 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CRTC3Q6UUV7 619 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 SNX20Q7Z614 316 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 NRROSQ86YC3 692 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 GPBAR1Q8TDU6 330 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 HDAC10Q969S8 669 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 DUSP23Q9BVJ7 150 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 RMI1Q9H9A7 625 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 TPP1O14773 563 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 GRID2O43424 1007 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 VEGFDO43915 354 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 AKT1P31749 480 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 DRG2P55039 364 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 DNAJC3Q13217 504 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CUL1Q13616 776 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 PROX2Q3B8N5 592 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf50-201ENST00000372478 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms