RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 ASB18Q6ZVZ8 466 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 SZRD1Q7Z422 152 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC190Q86UF4 302 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 TMPRSS12Q86WS5 348 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 KMT5CQ86Y97 462 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP3.77□□□□□ -1.811e-6■■■□□ 15.9
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNH5Q8NCM2 988 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 BBS10Q8TAM1 723 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC44A1Q8WWI5 657 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAAF4Q8WXU2 420 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 SMC6Q96SB8 1091 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 PKP4Q99569 1192 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA3CQ99985 751 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 PAG1Q9NWQ8 432 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 PROCRQ9UNN8 238 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 PRAG1Q86YV5 1406 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 TAF1P21675 1872 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PP11 408 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 PLPP2O43688 288 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 CDH1P12830 882 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP14P50281 582 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 FUT6P51993 359 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF132P52740 706 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 GAS1P54826 345 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 COG7P83436 770 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 RUNX1T1Q06455 604 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 SPOCK1Q08629 439 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 CUL4AQ13619 759 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 ACVR2BQ13705 512 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 GTF2H2Q13888 395 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF234Q14588 700 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 SYT16Q17RD7 645 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 CFAP161Q6P656 301 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 NAGSQ8N159 534 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 TMTC2Q8N394 836 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 EMC1Q8N766 993 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 POC1AQ8NBT0 407 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC38A5Q8WUX1 472 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 LMLNQ96KR4 655 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 GFI1Q99684 422 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 SYT17Q9BSW7 474 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF556Q9HAH1 456 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL1Q9NR64 748 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 WWOXQ9NZC7 414 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 POU2F3Q9UKI9 436 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PQ09 198 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PR77 199 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 ASPDHA6ND91 283 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM8BA6NDV4 472 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS44E7EML9 344 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 GJB3O75712 270 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 TSPAN9O75954 239 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 CSH1P0DML2 217 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 CSH2P0DML3 217 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 HRH2P25021 359 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKG2Q13237 762 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 WTAPQ15007 396 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL22Q53GT1 634 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 RILPL1Q5EBL4 403 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR78Q5VTH9 848 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 WBP2NLQ6ICG8 309 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 RAD9BQ6WBX8 426 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 Q75L30 129 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 EXOC3L1Q86VI1 746 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP97Q8IW35 865 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms