RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 NSG1P42857 185 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ASPAP45381 313 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 RPS24P62847 133 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 COX10Q12887 443 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ADGRF1Q5T601 910 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 TTC27Q6P3X3 843 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 CLEC20AQ6ZU45 233 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM192Q8IY95 271 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 LEMD2Q8NC56 503 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 NTAN1Q96AB6 310 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 RACGAP1Q9H0H5 632 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF180Q9UJW8 692 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 GON4LQ3T8J9 2241 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ABCC6O95255 1503 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ENTPD5O75356 428 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 COL6A1P12109 1028 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 CMPK1P30085 196 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 SPIBQ01892 262 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 C2orf80Q0P641 193 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ACAP2Q15057 778 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 PPM1JQ5JR12 505 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 METTL21CQ5VZV1 264 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM220Q6QAJ8 160 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 OR4A15Q8NGL6 344 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 SUSD3Q96L08 255 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 TTYH3Q9C0H2 523 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 RNF39Q9H2S5 420 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 NUDT4Q9NZJ9 180 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 TRPS1Q9UHF7 1281 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 VNN1O95497 513 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 LCP2Q13094 533 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 KLF10Q13118 480 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 DEF8Q6ZN54 512 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 FAM220AQ7Z4H9 259 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 IZUMO1Q8IYV9 350 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 UXS1Q8NBZ7 420 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 MAT2BQ9NZL9 334 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 CACNG4Q9UBN1 327 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 TLR6Q9Y2C9 796 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 WBP4O75554 376 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 TBX18O95935 607 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 GOT2P00505 430 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ALAS2P22557 587 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 RABGGTBP53611 331 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 CHIT1Q13231 466 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 DPYSL2Q16555 572 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 MINDY4Q4G0A6 757 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ANKRD22Q5VYY1 191 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 FAM180AQ6UWF9 173 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 METTL21AQ8WXB1 218 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 PPM1MQ96MI6 270 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 BRINP2Q9C0B6 783 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 YIPF1Q9Y548 306 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 MFN2O95140 757 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 BNC1Q01954 994 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 SP2Q02086 613 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 CLCQ05315 142 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 LGALS3BPQ08380 585 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 IL23RQ5VWK5 629 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 FSTL4Q6MZW2 842 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 KLHL25Q9H0H3 589 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 MINDY3Q9H8M7 445 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 GKN1Q9NS71 199 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 IGSF9Q9P2J2 1179 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 SEC14L3Q9UDX4 400 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 SLC35G6P0C7Q6 338 aa10.23□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 SCNN1AP37088 669 aa10.23□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF132P52740 706 aa10.23□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 KCNJ2P63252 427 aa10.23□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 LAPTM5Q13571 262 aa10.23□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 MED27Q6P2C8 311 aa10.23□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 PROSER1Q86XN7 944 aa10.23□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 NPLOC4Q8TAT6 608 aa10.23□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 CLEC4CQ8WTT0 213 aa10.23□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
ZNF548-202ENST00000366197 B3GALT6Q96L58 329 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms