RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 AP2M1Q96CW1 435 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 NFS1Q9Y697 457 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 OR2AG2A6NM03 316 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 IQCF5A8MTL0 148 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 PIRO00625 290 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 TRBC1P01850 177 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 TLE6Q9H808 572 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 NAE1Q13564 534 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 DPYSQ14117 519 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 CIB1Q99828 191 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 IGFBP4P22692 258 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 KIR3DL1P43629 444 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 BHLHB9Q6PI77 547 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 VPS35Q96QK1 796 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 GKN1Q9NS71 199 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 NEMP2A6NFY4 417 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 MED26O95402 600 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 CCDC157Q569K6 752 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 C17orf64Q86WR6 236 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 MYH6P13533 1939 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 C8AP07357 584 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 HTR1BP28222 390 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 MIOSQ9NXC5 875 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 CAPN1P07384 714 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 CYP4F8P98187 520 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 TRAF3Q13114 568 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 ARVCFO00192 962 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 SUV39H1O43463 412 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 EDNRBP24530 442 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 C21orf59P57076 290 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 USP46P62068 366 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 FAM47BQ8NA70 645 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 ELP6Q0PNE2 266 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 GPAT3Q53EU6 434 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 PALMDQ9NP74 551 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 TALDO1P37837 337 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 LIPEQ05469 1076 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 OXSMQ9NWU1 459 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 ITM2AO43736 263 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 SLC6A2P23975 617 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 RNFT2Q96EX2 444 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 FAM25AB3EWG3 89 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 FAM25CB3EWG5 89 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 FAM25GB3EWG6 89 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 J3KR12 359 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 NFATC1O95644 943 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 AMD1P17707 334 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 ADAM30Q9UKF2 790 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 PRNPP04156 253 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 TSPAN19P0C672 248 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 FEN1P39748 380 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 SPIBQ01892 262 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 MAPK11Q15759 364 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 RFX4Q33E94 735 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 ZNF599Q96NL3 588 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 PTPN2P17706 415 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 OLIG2Q13516 323 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms