RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM5Q9C035 493 aa20.87■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 RMI1Q9H9A7 625 aa20.87■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.87■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 PILRAQ9UKJ1 303 aa20.87■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SPOPO43791 374 aa20.86■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 KCNAB2Q13303 367 aa20.86■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.86■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 TADA1Q96BN2 335 aa20.86■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 RTP4Q96DX8 246 aa20.86■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 CTRCQ99895 268 aa20.86■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.86■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 KCNK6Q9Y257 313 aa20.86■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 PIRTP0C851 137 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ACP5P13686 325 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 CDKN2BP42772 138 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 CCR10P46092 362 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 NR2C2P49116 596 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF75DP51815 510 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 MC2RQ01718 297 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 CDK18Q07002 472 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SLC14A2Q15849 920 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 PCSK7Q16549 785 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 TEX44Q53QW1 395 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 IYDQ6PHW0 289 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 NCSTNQ92542 709 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SH3KBP1Q96B97 665 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 CATSPER2Q96P56 530 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SLC2A4P14672 509 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 MAPK9P45984 424 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 EPHA4P54764 986 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 TLE1Q04724 770 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 TFDP2Q14188 446 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 TAZQ16635 292 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ALS2CLQ60I27 953 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ZPBPQ9BS86 351 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SPRY4Q9C004 299 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 CARD9Q9H257 536 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 GLOD4Q9HC38 313 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 RAD18Q9NS91 495 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 TUBD1Q9UJT1 453 aa20.84■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 A6NCN8 305 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 PSTPIP1O43586 416 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 NUAK1O60285 661 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SNX2O60749 519 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 SLC4A1P02730 911 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 PTPN3P26045 913 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 MAGEA1P43355 309 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 DCDC1P59894 354 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 LLGL1Q15334 1064 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 TC2NQ8N9U0 490 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 GPR26Q8NDV2 337 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 TEKT5Q96M29 485 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 FBXO8Q9NRD0 319 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 KLHL3Q9UH77 587 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF711Q9Y462 761 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 ALG6Q9Y672 507 aa20.83■□□□□ 0.93
SOCS1-201ENST00000332029 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa20.82■□□□□ 0.92
SOCS1-201ENST00000332029 A0A0G2JNG1 304 aa20.82■□□□□ 0.92
SOCS1-201ENST00000332029 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.82■□□□□ 0.92
SOCS1-201ENST00000332029 KIR2DS3K7RE56 304 aa20.82■□□□□ 0.92
SOCS1-201ENST00000332029 NKX2-8O15522 239 aa20.82■□□□□ 0.92
SOCS1-201ENST00000332029 GRID2O43424 1007 aa20.82■□□□□ 0.92
SOCS1-201ENST00000332029 CST8O60676 142 aa20.82■□□□□ 0.92
SOCS1-201ENST00000332029 PMPCBO75439 489 aa20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms