RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF547Q8IVP9 402 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRSK1Q8TDC3 778 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC37A2Q8TED4 501 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRAMD1AQ96CP6 724 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC40Q9H9A6 602 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMOXQ9NWM0 555 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D29Q9UFV1 150 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBPLQ9UIM3 349 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMS2P1A4D2B8 440 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHPN2P1A8MT19 583 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPM1DO15297 605 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT1A9O60656 530 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF1O95521 474 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP2A1O95782 977 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT1A6P19224 532 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT1A1P22309 533 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT1A4P22310 534 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT1A3P35503 534 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT1A5P35504 534 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX1Q13596 522 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 C3orf38Q5JPI3 329 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRTM4Q86VH4 590 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFRP1Q8N474 314 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDHD1Q8NEL9 900 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4K2Q8NGD2 314 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GDAP1Q8TB36 358 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC45Q96CN5 670 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT1A7Q9HAW7 530 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT1A10Q9HAW8 530 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT1A8Q9HAW9 530 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC23A2Q9UGH3 650 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SATB2Q9UPW6 733 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR19A6NJB7 356 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 B4GAT1O43505 415 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK14O94921 469 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRTAMO95727 393 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 STIP1P31948 543 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 FASLGP48023 281 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSSP48449 732 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLCNKAP51800 687 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1D5P58170 312 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGA9Q13797 1035 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPRC6AQ5T6X5 926 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR13C4Q8NGS5 318 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMM29Q9BSF4 260 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXP3Q9BZS1 431 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNF1Q9H3M0 494 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLC4Q9NSK0 619 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF148Q9UQR1 794 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 BPTFQ12830 3046 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAMA5O15230 3695 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSPP15924 2871 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 KMOO15229 486 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 LDB2O43679 373 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX2O60749 519 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 DXOO77932 396 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNB1P01574 187 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGGP02679 453 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCKBRP32239 447 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR3P46089 330 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 INHBCP55103 352 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 XIAPP98170 497 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 BIRC2Q13490 618 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 INSCQ1MX18 579 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D25Q3MII6 688 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 LDLRAP1Q5SW96 308 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf96Q7Z7L8 435 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRUNE1Q86TP1 453 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLITRK4Q8IW52 837 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLIS1Q8NBF1 620 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF398Q8TD17 642 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC187A0A096LP49 1063 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMD3O43242 534 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRP72O76094 671 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 F3P13726 295 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETS1P14921 441 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPH1P17752 444 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDH4A1P30038 563 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTSCP53634 463 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE1BQ01064 536 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTF2H3Q13889 308 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNG2Q16589 344 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMZ1Q400G9 498 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP9Q49MG5 647 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 IYDQ6PHW0 289 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGF2-ASQ6U949 168 aa19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms