RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 TUBB1Q9H4B7 451 aa21.54■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.54■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 CD274Q9NZQ7 290 aa21.54■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 APPL1Q9UKG1 709 aa21.54■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 PSMD13Q9UNM6 376 aa21.54■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 CYBBP04839 570 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 ADH1AP07327 375 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 GPX3P22352 226 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 PSMD8P48556 350 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 AGTR2P50052 363 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 HK3P52790 923 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 MS4A2Q01362 244 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 ZFP1Q6P2D0 407 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 SNX20Q7Z614 316 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 SERPINA9Q86WD7 417 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 OR9I1Q8NGQ6 314 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 TUBGCP3Q96CW5 907 aa21.53■■□□□ 1.04
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SPHK1-201ENST00000323374 A0A1B0GTL3 188 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 MRASO14807 208 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 PFKLP17858 780 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 LBPP18428 481 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 ITGALP20701 1170 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.045e-7■■■□□ 15.2
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SPHK1-201ENST00000323374 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 SNX31Q8N9S9 440 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 OR56A4Q8NGH8 313 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 CORO1BQ9BR76 489 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 HGH1Q9BTY7 390 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL4Q9C0H6 718 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 CXorf56Q9H5V9 222 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 ASB8Q9H765 288 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 ASAH2Q9NR71 780 aa21.53■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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SPHK1-201ENST00000323374 ESRRBO95718 433 aa21.52■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 LINC00032P0C843 101 aa21.52■■□□□ 1.04
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SPHK1-201ENST00000323374 HACD2Q6Y1H2 254 aa21.52■■□□□ 1.04
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SPHK1-201ENST00000323374 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 POLG2Q9UHN1 485 aa21.52■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.52■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 BTRCQ9Y297 605 aa21.52■■□□□ 1.04
SPHK1-201ENST00000323374 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.52■■□□□ 1.03
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SPHK1-201ENST00000323374 E7ENX8 843 aa21.52■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 GIPC1O14908 333 aa21.52■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CHEK2O96017 543 aa21.52■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 GRB7Q14451 532 aa21.52■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 TRIP10Q15642 601 aa21.52■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 RBBP7Q16576 425 aa21.52■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CDKN3Q16667 212 aa21.52■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.52■■□□□ 1.03
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SPHK1-201ENST00000323374 FUNDC1Q8IVP5 155 aa21.52■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 MIER2Q8N344 545 aa21.52■■□□□ 1.03
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SPHK1-201ENST00000323374 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa21.51■■□□□ 1.03
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SPHK1-201ENST00000323374 ACOT8O14734 319 aa21.51■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 KIAA0355O15063 1070 aa21.51■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 UROSP10746 265 aa21.51■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 HGFP14210 728 aa21.51■■□□□ 1.03
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SPHK1-201ENST00000323374 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa21.51■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 SYVN1Q86TM6 617 aa21.51■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 PDSS2Q86YH6 399 aa21.51■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 PQLC1Q8N2U9 271 aa21.51■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.51■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 ASB9Q96DX5 294 aa21.51■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CIPCQ9C0C6 399 aa21.51■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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