RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 HADHAP40939 763 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 TMPRSS15P98073 1019 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 PEX6Q13608 980 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 SEPT6Q14141 434 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 MAPK15Q8TD08 544 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF398Q8TD17 642 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 GATA6Q92908 595 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 CASS4Q9NQ75 786 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 KCND1Q9NSA2 647 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 IGF2RP11717 2491 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 CDK14O94921 469 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 NFATC2Q13469 925 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 LRRTM4Q86VH4 590 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF547Q8IVP9 402 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 NAGSQ8N159 534 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 PATE1Q8WXA2 126 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC74AQ96AQ1 378 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 ASB8Q9H765 288 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 KCNK6Q9Y257 313 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-201ENST00000301730 MROH6A6NGR9 719 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 AGAP14A8MT82 685 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 H7C0S8 307 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 CCL22O00626 93 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 KMOO15229 486 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 FANCGO15287 622 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 PHF2O75151 1096 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 ECEL1O95672 775 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 JUPP14923 745 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 GLB1P16278 677 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 PSMA3P25788 255 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 STYXQ8WUJ0 223 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 ABCG4Q9H172 646 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 EML2O95834 649 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 GAS8O95995 478 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 MT-CO3P00414 261 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 KRT14P02533 472 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 MC4RP32245 332 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 FNTAP49354 379 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 CLCNKAP51800 687 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 CAMK2BQ13554 666 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 GTF2H3Q13889 308 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC38Q502W7 563 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 TTC25Q96NG3 672 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 RANBP9Q96S59 729 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 TIMM29Q9BSF4 260 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 SLC23A2Q9UGH3 650 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC78A2IDD5 438 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 HEATR9A2RTY3 570 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 A6NCN8 305 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 PRR19A6NJB7 356 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 PNLIPP16233 465 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 TPSB2P20231 275 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 ITGALP20701 1170 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 VPS41P49754 854 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 CTSCP53634 463 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 TPSAB1Q15661 275 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 MICALCLQ6ZW33 695 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 SNX20Q7Z614 316 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-201ENST00000301730 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms