RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CLPBQ9H078 707 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 B2RBV5 119 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SUPT3HB4E1H0 165 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 RFXAPO00287 272 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 DCXO43602 365 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SUPT3HO75486 399 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ECI2O75521 394 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 GFAPP14136 432 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 TEX9Q8N6V9 391 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SMARCD2Q92925 531 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CTSLP07711 333 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 C1SP09871 688 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ITGB6P18564 788 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO48Q5FWF7 155 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 TTC1Q99614 292 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CDYLQ9Y232 598 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 DHRS7Q9Y394 339 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 GSC2O15499 205 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V1G2O95670 118 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SLC6A11P48066 632 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 METTL21CQ5VZV1 264 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 POU5F2Q8N7G0 328 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 GPR33Q49SQ1 333 aa22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ACAD11Q709F0 780 aa22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 NXPE1Q8N323 547 aa22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO39Q8N4B4 442 aa22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 TRMOQ9BU70 441 aa22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ABCG8Q9H221 673 aa22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 GNPTGQ9UJJ9 305 aa22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 REV3LO60673 3130 aa22.54■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PQ67 120 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC189A1A4V9 331 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PPP6CO00743 305 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 NXNQ6DKJ4 435 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 FAM13CQ8NE31 585 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 NXPE3Q969Y0 559 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CD84Q9UIB8 345 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 AGAP14A8MT82 685 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PRRT4C9JH25 899 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN5P54829 565 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 BTKQ06187 659 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 POM121L1PQ3SYA9 428 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM198Q66K66 360 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 IL36AQ9UHA7 158 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.53■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM16O95361 564 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SPINT3P49223 89 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 HK3P52790 923 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 GAB4Q2WGN9 574 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC6AQ6EIG7 209 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 TRAF6Q9Y4K3 522 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SYCE1LA8MT33 242 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SDHDO14521 159 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 NFATC1O95644 943 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SH3BP2P78314 561 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 RIPK1Q13546 671 aa22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 TRPC5OSA6NMA1 111 aa22.51■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 MEI4A8MW99 385 aa22.51■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ASLP04424 464 aa22.51■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CD1EP15812 388 aa22.51■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 KLF10Q13118 480 aa22.51■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SNCBQ16143 134 aa22.51■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 TMPRSS6Q8IU80 811 aa22.51■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 STON2Q8WXE9 905 aa22.51■■□□□ 1.19
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