RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293880.9

SSRP1-202, Transcript of structure specific recognition protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SSRP1, Length 6,296 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1-202ENST00000293880 IFNA6P05013 189 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 PGRP06401 933 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 IGFBP4P22692 258 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 RAB25P57735 213 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 EVX2Q03828 476 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 DNASE1L2Q92874 299 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 EBF3Q9H4W6 596 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ABCG2Q9UNQ0 655 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 TNFSF13BQ9Y275 285 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 PRH1P02810 166 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ATF6P18850 670 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 CXCR2P25025 360 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 AXLP30530 894 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 UAP1L1Q3KQV9 507 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 MINDY2Q8NBR6 621 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 IRAK3Q9Y616 596 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 WFS1O76024 890 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 COL6A1P12109 1028 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 BMP6P22004 513 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 LIPEQ05469 1076 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ZBTB6Q15916 424 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 IDNKQ5T6J7 187 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 TMEM86AQ8N2M4 240 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 LIX1Q8N485 282 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 UBE2E3Q969T4 207 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 DNAJC11Q9NVH1 559 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 DHFRP00374 187 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ZPBP2Q6X784 338 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 FAM110BQ8TC76 370 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 PSME2Q9UL46 239 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 TESMINQ9Y4I5 508 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 HDCP19113 662 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 S100GP29377 79 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 SMIM11AP58511 58 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 BNC1Q01954 994 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 KLF10Q13118 480 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 LINGO2Q7L985 606 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 TRABD2AQ86V40 505 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 LPGAT1Q92604 370 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ACTL7BQ9Y614 415 aa16.03■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 H3BSH0 61 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 CSN2P05814 226 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 PAX3P23760 479 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 MNDAP41218 407 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ALDH3A2P51648 485 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 CCL23P55773 120 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 HSPB3Q12988 150 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ARMC5Q96C12 935 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ZNF570Q96NI8 536 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 RNF38Q9H0F5 515 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 PLK2Q9NYY3 685 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 ENPP3O14638 875 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 PLIN3O60664 434 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 OR4Q2P0C623 313 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 NOMO3P69849 1222 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 DIP2BQ9P265 1576 aa16.02■□□□□ 0.16
SSRP1-202ENST00000293880 MFSD11O43934 449 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 PAGE1O75459 146 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 C9orf64Q5T6V5 341 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 LINGO4Q6UY18 593 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 P2RY11Q96G91 374 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 MYO19Q96H55 970 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ACADLP28330 430 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 DNASE1L1P49184 302 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 RTP1P59025 263 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ENPEPQ07075 957 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 PRKG2Q13237 762 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CAPSQ13938 189 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 AAGABQ6PD74 315 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 HAS1Q92839 578 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 TAMM41Q96BW9 452 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 OR14I1A6ND48 311 aa16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 APOL3O95236 402 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.1 ms