RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 MFSD5Q6N075 450 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SLC7A4O43246 635 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ATP12AP54707 1039 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DPYSL2Q16555 572 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ZNF516Q92618 1163 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TBX18O95935 607 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 IRGCQ6NXR0 463 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 MED27Q6P2C8 311 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TWIST2Q8WVJ9 160 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 FPGTO14772 594 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 FAM163BP0C2L3 166 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ALAS2P22557 587 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 NSG1P42857 185 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CA9Q16790 459 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 UBXN11Q5T124 520 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 LMLNQ96KR4 655 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CSKP41240 450 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 RAB14P61106 215 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ARHGAP8P85298 464 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 EQTNQ9NQ60 294 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CCNA2P20248 432 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ITGAXP20702 1163 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CLCQ05315 142 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 C2orf80Q0P641 193 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 LCP2Q13094 533 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 NR1D2Q14995 579 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ADGRF1Q5T601 910 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CNTN3Q9P232 1028 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 GRIN2DO15399 1336 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TEX47Q8TBZ9 253 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 NPAS2Q99743 824 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 AKT2P31751 481 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TAS2R41P59536 307 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ZNF536O15090 1300 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SNAP91O60641 907 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CARD16Q5EG05 197 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 OLFM1Q99784 485 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 RTKNQ9BST9 563 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 MCIDASD6RGH6 385 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 CLDN4O14493 209 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 FFAR2O15552 330 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SYN1P17600 705 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 KRT77Q7Z794 578 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ZNF563Q8TA94 476 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 GKN1Q9NS71 199 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-202ENST00000285681 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 C9IYK1 514 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 GJA9P57773 515 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 CHIT1Q13231 466 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 HID1Q8IV36 788 aa20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms