RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 SATB2Q9UPW6 733 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 ANKDD1BA6NHY2 528 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 SERPINI2O75830 405 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 TBX18O95935 607 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 UMPSP11172 480 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 IGFBP5P24593 272 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 C8orf4Q9NR00 106 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 SUV39H1O43463 412 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CARTPTQ16568 116 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 BRSK1Q8TDC3 778 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 MYDGFQ969H8 173 aa21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 BCKDKO14874 412 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 IMPDH1P20839 514 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CAPGP40121 348 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 SPIBQ01892 262 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 S100ZQ8WXG8 99 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 SPG21Q9NZD8 308 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 ALDH4A1P30038 563 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 MAPK8P45983 427 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 SEPHS1P49903 392 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 HERC3Q15034 1050 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 ATG10Q9H0Y0 220 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 PIM3Q86V86 326 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 GMLQ99445 158 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 ZBTB26Q9HCK0 441 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 TAF4O00268 1085 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 COL6A1P12109 1028 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 HTR7P34969 479 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 ATG14Q6ZNE5 492 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 ATL1Q8WXF7 558 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 HTRA1Q92743 480 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 TOR1BO14657 336 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CYP7B1O75881 506 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 OR6B1O95007 311 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 OGFOD2Q6N063 350 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 C10orf53Q8N6V4 93 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 KBTBD8Q8NFY9 601 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 MYO19Q96H55 970 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 NODALQ96S42 347 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 NPY6RQ99463 290 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CCDC106Q9BWC9 280 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 NLNQ9BYT8 704 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 NMUR1Q9HB89 426 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 KCNE2Q9Y6J6 123 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 OR6C75A6NL08 312 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 T-ENOLP0DO92 83 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 PAICSP22234 425 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CES1P23141 567 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 MTTPP55157 894 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 ACAT2Q9BWD1 397 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 RRAGCQ9HB90 399 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 GIMAP2Q9UG22 337 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 NOBOXO60393 691 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 NBNO60934 754 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 PAX3P23760 479 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 OSTM1Q86WC4 334 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CDK15Q96Q40 435 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 MUC13Q9H3R2 512 aa21.55■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 PRAMEF1O95521 474 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 PRKCGP05129 697 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 RHDQ02161 417 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 HPS1Q92902 700 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 TPK1Q9H3S4 243 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 HERVK_113P63132 956 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 DEPDC7Q96QD5 511 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 FEM1AQ9BSK4 669 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 ERVK-6Q9BXR3 956 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 ATP6V1HQ9UI12 483 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 RAB23Q9ULC3 237 aa21.54■■□□□ 1.04
USP12-201ENST00000282344 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms