RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.82□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.82□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PTPRDP23468 1912 aa14.82□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PQH9 124 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 FUOMA2VDF0 154 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 J3QRK9 145 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 UPK1AO00322 258 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TNFRSF10BO14763 440 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PRSS56P0CW18 603 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 IL12AP29459 219 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RELAQ04206 551 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 EMX2Q04743 252 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 XKR7Q5GH72 579 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ANKS6Q68DC2 871 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 XAF1Q6GPH4 301 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SYVN1Q86TM6 617 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 METTL23Q86XA0 190 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 LEMD2Q8NC56 503 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 OR2T11Q8NH01 316 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 HASPINQ8TF76 798 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SNX19Q92543 992 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 FBXL8Q96CD0 374 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 C1orf50Q9BV19 199 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GMIPQ9P107 970 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ECI2O75521 394 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 FUCA1P04066 466 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ARSFP54793 590 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GLYATQ6IB77 296 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SLC15A4Q8N697 577 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.81□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 K7EPI3 171 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 B3GAT3O94766 335 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CYP11A1P05108 521 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RHOQP17081 205 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GRIK1P39086 918 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 STC1P52823 247 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TTC3P53804 2025 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PHEXP78562 749 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CRY1Q16526 586 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SFRP1Q8N474 314 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SERPINB11Q96P15 392 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 DERL2Q9GZP9 239 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 FAM50BQ9Y247 325 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 MED16Q9Y2X0 877 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SOBPA7XYQ1 873 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PIRTP0C851 137 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CDH1P12830 882 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TCF3P15923 654 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 AGTR2P50052 363 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ALDH3A2P51648 485 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 BEX3Q00994 111 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 BROXQ5VW32 411 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 OR4L1Q8NH43 312 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CSF3RQ99062 836 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ACOX2Q99424 681 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 LRRC3Q9BY71 257 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 LHPPQ9H008 270 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PALMDQ9NP74 551 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.8□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CDC7O00311 574 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ENPP3O14638 875 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms