RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 GRXCR2A6NFK2 248 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ESRRBO95718 433 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 CD247P20963 164 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF773Q6PK81 442 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 MON1AQ86VX9 555 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 TANKQ92844 425 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 SLAMF8Q9P0V8 285 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 GMIPQ9P107 970 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF225Q9UK10 706 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM234BA2RU67 622 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 POMCP01189 267 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 TMBIM6P55061 237 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 MOGQ16653 247 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 PYCR3Q53H96 274 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC3Q9BY71 257 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 SCML2Q9UQR0 700 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 Q9Y3F1 56 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 SYCE1LA8MT33 242 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 RHOBTB1O94844 696 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 PRSS23O95084 383 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH1P12830 882 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF12P17014 697 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ERVK-8P63133 956 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 PLCL1Q15111 1095 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 NTN4Q9HB63 628 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 TAS2R13Q9NYV9 303 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa21.96■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX2O60749 519 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 GJB3O75712 270 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 CHEK2O96017 543 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD51Q06609 339 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TSNQ15631 228 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 DPP10Q8N608 796 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 IGSF8Q969P0 613 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SEPHS2Q99611 448 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PFDN4Q9NQP4 134 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PCTPQ9UKL6 214 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 USP22Q9UPT9 525 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF623O75123 536 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 MLYCDO95822 493 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 ALBP02768 609 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TYMPP19971 482 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 IL12AP29459 219 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 YAP1P46937 504 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SERINC3Q13530 473 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 NEDD8Q15843 81 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 HID1Q8IV36 788 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2T11Q8NH01 316 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 ACDQ96AP0 544 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHA8Q96JA3 519 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 COX4I2Q96KJ9 171 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SUSD3Q96L08 255 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.95■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 UPK1AO00322 258 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 CD97P48960 835 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 C21orf59P57076 290 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4D2P58180 307 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 NFATC3Q12968 1075 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PARP15Q460N3 678 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 MORN1Q5T089 497 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PALMDQ9NP74 551 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SUN2Q9UH99 717 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 DRGXA6NNA5 263 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 MUSKO15146 869 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 KPNA6O60684 536 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TULP3O75386 442 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SEC14L2O76054 403 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 CHRNA1P02708 482 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 GALNT3Q14435 633 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TIGD2Q4W5G0 525 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 GLYATQ6IB77 296 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXL22Q6P050 247 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 XKR5Q6UX68 686 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SFRP1Q8N474 314 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 NSMCE2Q96MF7 247 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF145Q96MT1 663 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 MUS81Q96NY9 551 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD36A6QL64 1941 aa21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.93■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 CDC7O00311 574 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms