RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6C1Q96RD1 312 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 RMI1Q9H9A7 625 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO1AQ9UBC5 1043 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 KCND3Q9UK17 655 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CHKBQ9Y259 395 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PIPSLA2A3N6 862 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 A6NCN8 305 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 RASSF9O75901 435 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA10O95299 355 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 AMD1P17707 334 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CASP14P31944 242 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3BP2P78314 561 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 LPCAT1Q8NF37 534 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 SCINQ9Y6U3 715 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 GRID2O43424 1007 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNYL3P0C7X3 344 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CA4P22748 312 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 IL1R2P27930 398 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PMS2P54278 862 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 ERGIC2Q96RQ1 377 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 VIPP01282 170 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 FTLP02792 175 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PCK1P35558 622 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 DSC2Q02487 901 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 BOLA3Q53S33 107 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 KLC4Q9NSK0 619 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 FADS2P1A8MWK0 482 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 UBXN7O94888 489 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF4P15884 667 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 DNASE1L3Q13609 305 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CPT1CQ8TCG5 803 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT11Q9BT88 431 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM83DQ9H4H8 585 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ARFGAP3Q9NP61 516 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PKD2L2Q9NZM6 624 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 OGFRQ9NZT2 677 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CREG1O75629 220 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 MTA2O94776 668 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 C9P02748 559 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT81Q14533 505 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 IL11RAQ14626 422 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM26Q6ZUK4 368 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX26Q8N6G2 289 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 GALNT11Q8NCW6 608 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CARD9Q9H257 536 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJB5O75953 348 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PDGFAP04085 211 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 RARAP10276 462 aa26.99■■□□□ 1.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ASIC2Q16515 512 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CRTC3Q6UUV7 619 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CCHCR1Q8TD31 782 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SSC4DQ8WTU2 575 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR24Q96S15 920 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2AG1Q9H205 316 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 HAUS2Q9NVX0 235 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN10Q9UBB4 475 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PADI1Q9ULC6 663 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
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CAPNS1-217ENST00000629983 INSCQ1MX18 579 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R3BQ86XI6 285 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CT55Q8WUE5 264 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM11Q96F44 468 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 UCK1Q9HA47 277 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDH9Q9HC56 1237 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO9AB2RTY4 2548 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 MT-ND3P03897 115 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CES1P23141 567 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF165P49910 485 aa26.97■■□□□ 1.91
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