RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 TBC1D29Q9UFV1 150 aa23.32■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM153AQ9UHL3 310 aa23.32■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.32■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 AURKAO14965 403 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 GRID2O43424 1007 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 EPOP01588 193 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 NFKB1P19838 968 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 WNT3AP56704 352 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 C16orf72Q14CZ0 275 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 PPP2R5EQ16537 467 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 NKAIN2Q5VXU1 208 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 ALS2CLQ60I27 953 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 PDPK2PQ6A1A2 396 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 IYDQ6PHW0 289 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 BBS12Q6ZW61 710 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 DAAM2Q86T65 1068 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF567Q8N184 647 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 FCRL5Q96RD9 977 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 VAT1Q99536 393 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 A6NCN8 305 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 HACD1B0YJ81 288 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 TK2O00142 265 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 AGRPO00253 132 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 LIMK2P53671 638 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 VAC14Q08AM6 782 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 ARHGAP40Q5TG30 622 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 PID1Q7Z2X4 250 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 JAMLQ86YT9 394 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC50Q8IVM0 306 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 HTR3CQ8WXA8 447 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 GLYATL1Q969I3 302 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 HAUS1Q96CS2 278 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 HEMGNQ9BXL5 484 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 KCNK6Q9Y257 313 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 MGAQ8IWI9 3026 aa23.3■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 CHUKO15111 745 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 ACP5P13686 325 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 CLCNKAP51800 687 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 COPS2P61201 443 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 XRCC4Q13426 336 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 PCSK4Q6UW60 755 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 OR4D9Q8NGE8 314 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 USP7Q93009 1102 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 MRGPRX2Q96LB1 330 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 OR2AG1Q9H205 316 aa23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 BTNL10A8MVZ5 291 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 GPR89AB7ZAQ6 455 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 EFSO43281 561 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 APOC2P02655 101 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC4A1P02730 911 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 GPR89BP0CG08 455 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 CCL4P13236 92 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 HMGCLP35914 325 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 GPLD1P80108 840 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 NOMO1Q15155 1222 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 SIRPB2Q5JXA9 342 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 TTC30BQ8N4P2 665 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 RCBTB1Q8NDN9 531 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC39A7Q92504 469 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC74BQ96LY2 380 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 DPYSL5Q9BPU6 564 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 B3GNT4Q9C0J1 378 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 BPIFA1Q9NP55 256 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 PDP2Q9P2J9 529 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 TRHDEQ9UKU6 1024 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 EFR3BQ9Y2G0 817 aa23.28■■□□□ 1.32
PPP1CC-211ENST00000620030 FASNP49327 2511 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
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