RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SHC3	Q92529	594 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NFASC	O94856	1347 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ALPK3	Q96L96	1907 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525		M0R3H8	397 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLF11	O14901	512 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ALOX15B	O15296	676 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MSH4	O15457	936 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ENTPD3	O75355	529 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLITRK3	O94933	977 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TH	P07101	528 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACTN1	P12814	892 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MARK3	P27448	753 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTPN4	P29074	926 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SFN	P31947	248 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HOXD13	P35453	343 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC11A2	P49281	568 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DIO1	P49895	249 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NCALD	P61601	193 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HSF1	Q00613	529 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLC1	Q07866	573 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CENPU	Q71F23	418 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BICD1	Q96G01	975 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MIS12	Q9H081	205 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AZI2	Q9H6S1	392 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms