RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	NDUFS7	O75251	213 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPC4	O75487	556 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	FTCD	O95954	541 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	GLUD1	P00367	558 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	RB1	P06400	928 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM11	P17152	192 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	TM4SF1	P30408	202 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	BDKRB2	P30411	391 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	GCH1	P30793	250 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	GLUD2	P49448	558 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	RAD23B	P54727	409 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	TFAP4	Q01664	338 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRAF2	Q12933	501 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDC16	Q13042	620 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHAF1B	Q13112	559 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	FHL1	Q13642	323 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACVR2B	Q13705	512 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	WTAP	Q15007	396 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	EFNB3	Q15768	340 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CTF1	Q16619	201 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDON	Q4KMG0	1287 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	RGMB	Q6NW40	437 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	DPPA4	Q7L190	304 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	HACE1	Q8IYU2	909 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	TAGAP	Q8N103	731 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	PGBD5	Q8N414	524 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC89	Q8N998	374 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	OR8K5	Q8NH50	307 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ORAI1	Q96D31	301 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CALML4	Q96GE6	196 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZPBP	Q9BS86	351 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLK3	Q9H4B4	646 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	SETD4	Q9NVD3	440 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	MALT1	Q9UDY8	824 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABCC3	O15438	1527 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	HCRTR2	O43614	444 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	HS6ST1	O60243	411 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	JRK	O75564	520 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCNK5	O95279	499 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	NTN1	O95631	604 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAOA	P21397	527 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACTN2	P35609	894 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRCP	P42785	496 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CAMP	P49913	170 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	PEX5	P50542	639 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	MSH6	P52701	1360 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	NLRP5	P59047	1200 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZBED6	P86452	979 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	BNC1	Q01954	994 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CREB5	Q02930	508 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRMP	Q12912	555 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPS8	Q12929	822 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRAF3	Q13114	568 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	TOMM20	Q15388	145 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADIPOQ	Q15848	244 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	AMZ1	Q400G9	498 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	SZRD1	Q7Z422	152 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	NME8	Q8N427	588 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		3.06	□□□□□ -1.92

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