RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 PORP16435 677 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYF6P23409 242 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ETFBP38117 255 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 NFKB2Q00653 900 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACVR1Q04771 509 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 DSC1Q08554 894 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLEC6AQ6EIG7 209 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 LPGAT1Q92604 370 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 HDCP19113 662 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 FDXRP22570 491 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CBX3Q13185 183 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 EML3Q32P44 896 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 UNC50Q53HI1 259 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABI1Q8IZP0 508 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTERQ96BW5 349 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBATAQ96M53 351 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 PALMDQ9NP74 551 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 IL37Q9NZH6 218 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 DRGXA6NNA5 263 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAMP2O60895 175 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBX18O95935 607 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF12P17014 697 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 HMOX2P30519 316 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP4BP51164 291 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 HERVK_113P63132 956 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 PARP15Q460N3 678 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTX3Q5HYI7 312 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 C6orf10Q5SRN2 563 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CASD1Q96PB1 797 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF576Q9H609 170 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYO9BQ13459 2157 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 AKAP10O43572 662 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC4A1P02730 911 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CD1DP15813 335 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSPAN8P19075 237 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 YWHAQP27348 245 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ENTPD1P49961 510 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 SERINC3Q13530 473 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM219BQ5XKK7 198 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR152Q8TDT2 470 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 BORCS5Q969J3 196 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCF12Q99081 682 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 SEMA3CQ99985 751 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRASO14807 208 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAGEB3O15480 346 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 GJB3O75712 270 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLP2RO95838 553 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 PBX3P40426 434 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAGEA11P43364 429 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR1G1P47890 313 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 NME5P56597 212 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 MIB1Q86YT6 1006 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR150Q8NGU9 434 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 PEX13Q92968 403 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXO32Q969P5 355 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 C19orf60Q96EN9 201 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 FEM1CQ96JP0 617 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARL5AQ9Y689 179 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.17■□□□□ 0.82
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