RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF18	P17022	549 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CNTF	P26441	200 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R2	P41236	205 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SOX2	P48431	317 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CASP4	P49662	377 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	EFNA5	P52803	228 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TLE2	Q04725	743 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CDK18	Q07002	472 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	FOXF2	Q12947	444 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	STIM1	Q13586	685 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ALCAM	Q13740	583 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TFDP1	Q14186	410 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GPNMB	Q14956	572 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MAPK6	Q16659	721 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CLPB	Q9H078	707 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GUA9	196 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934		H0YCG3	227 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TP73	O15350	636 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TSPAN1	O60635	241 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	AKAP3	O75969	853 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PIGR	P01833	764 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NR3C1	P04150	777 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CSF1	P09603	554 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NR2F2	P24468	414 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	EPHB2	P29323	1055 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	LIG4	P49917	911 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MYL5	Q02045	173 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MGAT3	Q09327	533 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NPAS1	Q99742	590 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TSG101	Q99816	390 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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