RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556736.5

MEG3-227, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 1,689 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-227	ENST00000556736	OXSM	Q9NWU1	459 aa		18.07	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	MED16	Q9Y2X0	877 aa		18.07	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TARM1	B6A8C7	271 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	MBTPS2	O43462	519 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	CTH	P32929	405 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	OCRL	Q01968	901 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	DMTN	Q08495	405 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	CGB2	Q6NT52	195 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	DNASE1L2	Q92874	299 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	RAB7B	Q96AH8	199 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ARRDC3	Q96B67	414 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	CCDC126	Q96EE4	140 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	GPR21	Q99679	349 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	SMOX	Q9NWM0	555 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	NIPSNAP2	O75323	286 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	SBK3	P0C264	359 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ADRB3	P13945	408 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	CHRM3	P20309	590 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	NSG1	P42857	185 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ATP6V0D1	P61421	351 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	LIPM	Q5VYY2	423 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	LIPI	Q6XZB0	460 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	COPS8	Q99627	209 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	HDAC8	Q9BY41	377 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		18.06	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	C5orf42	Q9H799	3197 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	SZT2	Q5T011	3432 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	CCDC189	A1A4V9	331 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM114	B3SHH9	223 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736		F8W8V4	182 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736		K7EQS6	105 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	AREL1	O15033	823 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	CD1D	P15813	335 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TFEB	P19484	476 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF284	Q2VY69	593 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	MACC1	Q6ZN28	852 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736		Q6ZVL8	140 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	DERL2	Q9GZP9	239 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	KCNK12	Q9HB15	430 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		18.05	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ETV3	P41162	512 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	PSMD8	P48556	350 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	SLC1A6	P48664	564 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	PFKP	Q01813	784 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	SDE2	Q6IQ49	451 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	FAM136A	Q96C01	138 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	CD84	Q9UIB8	345 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		18.04	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		18.03	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	NEMP1	O14524	444 aa		18.03	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	WNT9A	O14904	365 aa		18.03	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	ADH1B	P00325	375 aa		18.03	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	LIG3	P49916	1009 aa		18.03	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	METAP1	P53582	386 aa		18.03	■□□□□ 0.48
MEG3-227	ENST00000556736	IL2	P60568	153 aa		18.03	■□□□□ 0.48

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