RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550446.5

LETMD1-224, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-224	ENST00000550446	GRID2	O43424	1007 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	PPFIA2	O75334	1257 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	MC2R	Q01718	297 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	GALNT3	Q14435	633 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	CNTD1	Q8N815	330 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	BMPER	Q8N8U9	685 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	FAF2	Q96CS3	445 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	HDAC11	Q96DB2	347 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	RTP4	Q96DX8	246 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	IQCD	Q96DY2	449 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SDK2	Q58EX2	2172 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	BSN	Q9UPA5	3926 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	NUAK1	O60285	661 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	GYPC	P04921	128 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	KDELR1	P24390	212 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	CASP14	P31944	242 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	MESD	Q14696	234 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ALS2CL	Q60I27	953 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	H2AFV	Q71UI9	128 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	COL26A1	Q96A83	441 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	RNF157	Q96PX1	679 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	CEP41	Q9BYV8	373 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	OR2AG1	Q9H205	316 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	CARD9	Q9H257	536 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	KLC4	Q9NSK0	619 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	IFNK	Q9P0W0	207 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	NENF	Q9UMX5	172 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446		A0A0G2JNG1	304 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446		A6NCN8	305 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	NKX2-8	O15522	239 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC4A1	P02730	911 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	PIRT	P0C851	137 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	F3	P13726	295 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC2A4	P14672	509 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	AP1B1	Q10567	949 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ZBTB17	Q13105	803 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	KIR2DS5	Q14953	304 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	EID2B	Q96D98	161 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	AGAP3	Q96P47	875 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	APMAP	Q9HDC9	416 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	LRRD1	A4D1F6	860 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ARHGAP6	O43182	974 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	MAN1A1	P33908	653 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	CCR10	P46092	362 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	EPHA4	P54764	986 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	POLE2	P56282	527 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	GPR26	Q8NDV2	337 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ZPBP	Q9BS86	351 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SPRY4	Q9C004	299 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		18.71	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	OR5K4	A6NMS3	321 aa		18.71	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	PRKAR1A	P10644	381 aa		18.71	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	TYRP1	P17643	537 aa		18.71	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	KCNAB2	Q13303	367 aa		18.71	■□□□□ 0.59

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