RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 OR1A2Q9Y585 309 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 LRRK2Q5S007 2527 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 GOLGA6BA6NDN3 693 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SCAMP1O15126 338 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 KCNN4O15554 427 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 MTSS1O43312 755 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 MPOP05164 745 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ETV3P41162 512 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 YPEL5P62699 121 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 NFKB2Q00653 900 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CDK18Q07002 472 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ENPP7Q6UWV6 458 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PELI3Q8N2H9 469 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SLC25A45Q8N413 288 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 OXR1Q8N573 874 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TADA1Q96BN2 335 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 NUS1Q96E22 293 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 IFT43Q96FT9 208 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 VAT1Q99536 393 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 USP29Q9HBJ7 922 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 GPR27Q9NS67 375 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 K7ESM1 405 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 MT-CO3P00414 261 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 DGKAP23743 735 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CXCR5P32302 372 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 WNT3AP56704 352 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 GABREP78334 506 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ILKQ13418 452 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 C1orf61Q13536 156 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SNX1Q13596 522 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PTK2BQ14289 1009 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TCEA2Q15560 299 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 FAXCQ5TGI0 409 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CCDC70Q6NSX1 233 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PNCKQ6P2M8 343 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 RBFAQ8N0V3 343 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 IPMKQ8NFU5 416 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TRIM58Q8NG06 486 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SCAMP4Q969E2 229 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 DTD2Q96FN9 168 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 FCRL5Q96RD9 977 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TRIB3Q96RU7 358 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 LGR4Q9BXB1 951 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ABCG8Q9H221 673 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ANKMY1Q9P2S6 941 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 BSNQ9UPA5 3926 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 TMEM202A6NGA9 273 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 YKT6O15498 198 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 FFAR2O15552 330 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 PIAS2O75928 621 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 NDST3O95803 873 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 AGTP01019 485 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms