RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548557.1

CASC18-202, Transcript of cancer susceptibility 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC18, Length 2,503 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC18-202ENST00000548557 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.56□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.56□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.56□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 EYSQ5T1H1 3165 aa6.56□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 TTC34A8MYJ7 566 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 FCHO1O14526 889 aa6.55□□□□□ -1.36
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CASC18-202ENST00000548557 BRINP1O60477 761 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 ADH5P11766 374 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 CRHR1P34998 444 aa6.55□□□□□ -1.36
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CASC18-202ENST00000548557 SEMA5AQ13591 1074 aa6.55□□□□□ -1.36
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CASC18-202ENST00000548557 TTC7BQ86TV6 843 aa6.55□□□□□ -1.36
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CASC18-202ENST00000548557 CPA6Q8N4T0 437 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 CCNYQ8ND76 341 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 ASB2Q96Q27 587 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 TCF12Q99081 682 aa6.55□□□□□ -1.36
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CASC18-202ENST00000548557 GYG2O15488 501 aa6.55□□□□□ -1.36
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CASC18-202ENST00000548557 GOSR1O95249 250 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.55□□□□□ -1.36
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CASC18-202ENST00000548557 HNF4AP41235 474 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 GRIA1P42261 906 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 SERPINB9P50453 376 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 TMPRSS15P98073 1019 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 CDK18Q07002 472 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 DMC1Q14565 340 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 CRY1Q16526 586 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 FBXO30Q8TB52 745 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 ACDQ96AP0 544 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 HMCESQ96FZ2 354 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 ZNF599Q96NL3 588 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 CATSPER2Q96P56 530 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 KXD1Q9BQD3 176 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 EBF3Q9H4W6 596 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 PLK2Q9NYY3 685 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 MALT1Q9UDY8 824 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.55□□□□□ -1.36
CASC18-202ENST00000548557 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.55□□□□□ -1.36
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