RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
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PTPRJ-205ENST00000527952 A0A0G2JNG1 304 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 KIR2DS3K7RE56 304 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 GYPCP04921 128 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 SEPHS1P49903 392 aa23.71■■□□□ 1.39
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