RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 AGAP11Q8TF27 550 aa17.39■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 ECHDC3Q96DC8 303 aa17.39■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 C1orf21Q9H246 121 aa17.39■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CD248Q9HCU0 757 aa17.39■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa17.39■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 IKZF3Q9UKT9 509 aa17.39■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 NOTCH4Q99466 2003 aa17.39■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 BTN3A1O00481 513 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CA5AP35218 305 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 KLF10Q13118 480 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 TMC5Q6UXY8 1006 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CHST14Q8NCH0 376 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 GIMAP7Q8NHV1 300 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 FAR2Q96K12 515 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 LYSMD1Q96S90 227 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 C19orf43Q9BQ61 176 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC28BQ9BUN5 200 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CLPBQ9H078 707 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 GOLGA8CPA6NN73 597 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 SYCE1LA8MT33 242 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 MEI4A8MW99 385 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CHUKO15111 745 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 SPAM1P38567 509 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 DNAL1Q4LDG9 190 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC66Q68CR7 880 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 GRAMD4Q6IC98 578 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CPNE9Q8IYJ1 553 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 AHI1Q8N157 1196 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 FBXO39Q8N4B4 442 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 NAT14Q8WUY8 206 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 LINGO1Q96FE5 620 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC3BQ96PB8 259 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 BOCQ9BWV1 1114 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CRLS1Q9UJA2 301 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 TRAF6Q9Y4K3 522 aa17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC14BA6NHZ5 514 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 ECI2O75521 394 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 TSPAN12O95859 305 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 TCF3P15923 654 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 NNMTP40261 264 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 BTKQ06187 659 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 NAA25Q14CX7 972 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CHRNA6Q15825 494 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 GEN1Q17RS7 908 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 WASHC2DQ5SRD0 308 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM198Q66K66 360 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 OR2A12Q8NGT7 310 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CEP70Q8NHQ1 597 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 SORCS1Q8WY21 1168 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 THTPAQ9BU02 230 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 MARK1Q9P0L2 795 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 ERVW-1Q9UQF0 538 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 PPIL1Q9Y3C6 166 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CCND1P24385 295 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CLCN7P51798 805 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC25A3Q00325 362 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 DHCR24Q15392 516 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 TRIM68Q6AZZ1 485 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CLEC6AQ6EIG7 209 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 RBFAQ8N0V3 343 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 GPR26Q8NDV2 337 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 STON2Q8WXE9 905 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 KLHL32Q96NJ5 620 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CATSPER2Q96P56 530 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC2A11Q9BYW1 496 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CIPCQ9C0C6 399 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 DHRS7Q9Y394 339 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 L3MBTL1Q9Y468 752 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CHD9Q3L8U1 2897 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC189A1A4V9 331 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 SDHDO14521 159 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 MAGEC1O60732 1142 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 ENTPD5O75356 428 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 WFS1O76024 890 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-204ENST00000519651 COX4I1P13073 169 aa17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms