RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PRAG1Q86YV5 1406 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PAGE4O60829 102 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 INHBAP08476 426 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 IL7RP16871 459 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 AHRP35869 848 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 RUNX1T1Q06455 604 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 DPCR1Q3MIW9 517 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 LCN10Q6JVE6 187 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 LGALS12Q96DT0 336 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 TBATAQ96M53 351 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 BARHL1Q9BZE3 327 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 MAGIXQ9H6Y5 334 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PREBQ9HCU5 417 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 TGFB1I1O43294 461 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 NKX2-2O95096 273 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 LDLRP01130 860 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 HARS2P49590 506 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 RARSP54136 660 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ERVK11-1P61568 191 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PMP22Q01453 160 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 CDONQ4KMG0 1287 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 SMARCE1Q969G3 411 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 FAM149B1Q96BN6 582 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 LRMDAQ9H2I8 198 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 JMJD4Q9H9V9 463 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1W2PP11 408 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 A6NLC8 198 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 CTSVO60911 334 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 MLLT10P55197 1068 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 OLR1P78380 273 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 COG7P83436 770 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ZBED6P86452 979 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 SFMBT2Q5VUG0 894 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ARHGAP17Q68EM7 881 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 METTL6Q8TCB7 284 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 MORC4Q8TE76 937 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ABHD8Q96I13 439 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 LITAFQ99732 161 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PIP5K1AQ99755 562 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1B0GVC2 190 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 C1orf226A1L170 272 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 OR5K3A6NET4 321 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 CSF2RAP15509 400 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ICAM3P32942 547 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PRCPP42785 496 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ACVR2BQ13705 512 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 FCN2Q15485 313 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 RDM1Q8NG50 284 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 SGCDQ92629 289 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PHF21AQ96BD5 680 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PDCL3Q9H2J4 239 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 SCPEP1Q9HB40 452 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1W2PPH5 198 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 BUD23O43709 281 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 BAG4O95429 457 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 CAVIN2O95810 425 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 HSD17B4P51659 736 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 CASP6P55212 293 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 KRTAP10-5P60370 271 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ADIPOQQ15848 244 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF876PQ49A33 203 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 WDR38Q5JTN6 314 aa4.85□□□□□ -1.63
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