RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 MESDQ14696 234 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 CLCA4Q14CN2 919 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SLC18A3Q16572 532 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 PLD5Q8N7P1 536 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 NCSTNQ92542 709 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 CEP41Q9BYV8 373 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 CARD9Q9H257 536 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 CLMPQ9H6B4 373 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ARFGAP3Q9NP61 516 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ATXN10Q9UBB4 475 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 LCMT1Q9UIC8 334 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 TENM4Q6N022 2769 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 RAD1O60671 282 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 WISP1O95388 367 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SFTPCP11686 197 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 F3P13726 295 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 RAB15P59190 212 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 AP1B1Q10567 949 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ALS2CLQ60I27 953 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 GPR26Q8NDV2 337 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 TRIB3Q96RU7 358 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 CTRCQ99895 268 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SPATA16Q9BXB7 569 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SHOC2Q9UQ13 582 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 TMEM253P0C7T8 217 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 PIRTP0C851 137 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SLC2A4P14672 509 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 MC2RQ01718 297 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SLC9A4Q6AI14 798 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 RTP4Q96DX8 246 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 AGAP3Q96P47 875 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 TRIM4Q9C037 500 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 BRD8Q9H0E9 1235 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 OR2AG1Q9H205 316 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 DEF6Q9H4E7 631 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 CPNE7Q9UBL6 633 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 KLHL3Q9UH77 587 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 PILRAQ9UKJ1 303 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ADGRG1Q9Y653 693 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 A0A0G2JNG1 304 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 OR5K4A6NMS3 321 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ZNF487B1APH4 448 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 KIR2DS3K7RE56 304 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 AKR1B10O60218 316 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SLC4A1P02730 911 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 TPM3P06753 285 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 EPHA4P54764 986 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 KIR2DS5Q14953 304 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 PCSK7Q16549 785 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 ZNF569Q5MCW4 686 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 NPNTQ6UXI9 565 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 NT5DC3Q86UY8 548 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 OR8K1Q8NGG5 319 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SPRY4Q9C004 299 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 TRIM39Q9HCM9 518 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 APMAPQ9HDC9 416 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 KLC4Q9NSK0 619 aa16.71■□□□□ 0.27
HERC3-211ENST00000513325 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.7■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 APOL1O14791 398 aa16.7■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 PPFIA2O75334 1257 aa16.7■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 CLCNKAP51800 687 aa16.7■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 DCDC1P59894 354 aa16.7■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 CDK18Q07002 472 aa16.7■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 PDK1Q15118 436 aa16.7■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 BORAQ6PGQ7 559 aa16.7■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.7■□□□□ 0.26
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