RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	KCNA5	P22460	613 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	AMPH	P49418	695 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PERP	Q96FX8	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TTC14	Q96N46	770 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A0B4J293	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	C1orf226	A1L170	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	LINC01565	O15544	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	KCNN4	O15554	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	WDR1	O75083	606 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CDH1	P12830	882 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	GALC	P54803	685 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TAS2R40	P59535	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF234	Q14588	700 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	NR4A3	Q92570	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PCYT2	Q99447	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TAF1	P21675	1872 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	MAP2K7	O14733	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ZBED4	O75132	1171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ITGA2	P17301	1181 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	FMO5	P49326	533 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CLCN3	P51790	818 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	DCAF7	P61962	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	DVL1	O14640	695 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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