RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494838.6

QARS-222, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene QARS, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-222	ENST00000494838	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		11.65	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838		B4E171	279 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	GRID2	O43424	1007 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PSTPIP1	O43586	416 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	VEGFD	O43915	354 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PRAMEF10	O60809	474 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	SOD1	P00441	154 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PRL	P01236	227 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	HGF	P14210	728 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	CETN2	P41208	172 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TSPAN7	P41732	249 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	CLCNKA	P51800	687 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	GTF2H3	Q13889	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TCEAL1	Q15170	157 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	SPA17	Q15506	151 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	QPCT	Q16769	361 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	HACD3	Q9P035	362 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	KMO	O15229	486 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PPM1D	O15297	605 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	NUAK1	O60285	661 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	KCNJ13	O60928	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	NDST3	O95803	873 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	FUCA1	P04066	466 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	F3	P13726	295 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	ITIH1	P19827	911 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	LY6D	Q14210	128 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	INSC	Q1MX18	579 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TRIM74	Q86UV6	250 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	FAM129C	Q86XR2	697 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TTC9	Q92623	222 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	P3H4	Q92791	437 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	GLOD4	Q9HC38	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	EFS	O43281	561 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	SNX2	O60749	519 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	DNAJC6	O75061	913 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	VIP	P01282	170 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	EPO	P01588	193 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	THRA	P10827	490 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	ACP5	P13686	325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TNNT1	P13805	278 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	DYNLT1	P63172	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	GALNT3	Q14435	633 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PCSK7	Q16549	785 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	CCDC181	Q5TID7	509 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	IYD	Q6PHW0	289 aa		11.62	□□□□□ -0.55
QARS-222	ENST00000494838	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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