RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 SNX31Q8N9S9 440 aa7□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 OR52K2Q8NGK3 314 aa7□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 OR13J1Q8NGT2 312 aa7□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 PYDC1Q8WXC3 89 aa7□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 LZICQ8WZA0 190 aa7□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 SLC35B4Q969S0 331 aa7□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 IFT43Q96FT9 208 aa7□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.99□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 TMEM247A6NEH6 219 aa6.99□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 F5H5T6 163 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 MATN2O00339 956 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 TBCCQ15814 346 aa6.99□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 SNX32Q86XE0 403 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 HPS6Q86YV9 775 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 69.6
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HERC4-211ENST00000492996 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 ALG9Q9H6U8 611 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 GMEB1Q9Y692 573 aa6.99□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 WASH4PA8MWX3 477 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 TMEM114B3SHH9 223 aa6.99□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 NUDT2P50583 147 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 PRKAA1Q13131 559 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 PTPRRQ15256 657 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 FSCBQ5H9T9 825 aa6.99□□□□□ -1.29
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