RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490444.2

PUM3-204, Transcript of pumilio RNA binding family member 3, human

TSL 5

Gene PUM3, Length 340 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM3-204	ENST00000490444	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	GLRX5	Q86SX6	157 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	TRIM74	Q86UV6	250 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	TRIM73	Q86UV7	250 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	FAM160B2	Q86V87	743 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	MON1A	Q86VX9	555 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	CNTROB	Q8N137	903 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	USP38	Q8NB14	1042 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	KDM1B	Q8NB78	822 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	SETD9	Q8NE22	299 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	SUN5	Q8TC36	379 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	NCSTN	Q92542	709 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	STAM	Q92783	540 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	FRG2B	Q96QU4	278 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	TRMO	Q9BU70	441 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	ACPT	Q9BZG2	426 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	USP44	Q9H0E7	712 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	VEZT	Q9HBM0	779 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	CD93	Q9NPY3	652 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	POLE3	Q9NRF9	147 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	FETUB	Q9UGM5	382 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	IL19	Q9UHD0	177 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	IL16	Q14005	1332 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	MST1R	Q04912	1400 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	CKAP5	Q14008	2032 aa		2.58	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	URAD	A6NGE7	173 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	LRRC72	A6NJI9	287 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	SYN3	O14994	580 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	SCAMP1	O15126	338 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	DIAPH2	O60879	1101 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	ENTPD3	O75355	529 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	GCNT3	O95395	438 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	NFATC1	O95644	943 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	IFNA2	P01563	188 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	INHBA	P08476	426 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	SPARC	P09486	303 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	CCDC172	P0C7W6	258 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	TPBGL	P0DKB5	382 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	CHRNB1	P11230	501 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	PSG1	P11464	419 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	FCGR2A	P12318	317 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	KRT5	P13647	590 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	CCNA2	P20248	432 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	CPT2	P23786	658 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	PRKCH	P24723	683 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	PTAFR	P25105	342 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	GSTM2	P28161	218 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	HNF1B	P35680	557 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	SOX6	P35712	828 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	EPS15	P42566	896 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	PTPN9	P43378	593 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	RABIF	P47224	123 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	OAZ1	P54368	228 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	ARHGAP8	P85298	464 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	RIPK1	Q13546	671 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	PTK6	Q13882	451 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	GALNT3	Q14435	633 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	MED22	Q15528	200 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	INA	Q16352	499 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	RPE65	Q16518	533 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	NTRK2	Q16620	822 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	NFIL3	Q16649	462 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	FBXO43	Q4G163	708 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	XKR9	Q5GH70	373 aa		2.57	□□□□□ -2
PUM3-204	ENST00000490444	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		2.57	□□□□□ -2

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