RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IKZF3Q9UKT9 509 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBX21Q9UL17 535 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCL26Q9Y258 94 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRTAMO95727 393 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRLP01236 227 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK4P11802 303 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CA5AP35218 305 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHN2P52757 468 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POU4F1Q01851 419 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF33AQ06730 810 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAF2Q12933 501 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEX26Q8N6G2 289 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EME1Q96AY2 570 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNDP1Q96KN2 507 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNA7Q96RP8 456 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VWA7Q9Y334 891 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INSL5Q9Y5Q6 135 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX13Q9Y5W8 968 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1B0GTL3 188 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1B0GTW7 788 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LCHNA4D1U4 455 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H3BMM5 538 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPST1O60507 370 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WEE1P30291 646 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STK19P49842 368 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDKL1Q00532 357 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRF1Q5T601 910 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDIASQ8IXT1 998 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM110BQ8TC76 370 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAI2Q9Y5P3 530 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A087X1B8 175 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLCO1B7G3V0H7 640 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNRH1P01148 92 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL6A2P12110 1019 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RING1Q06587 406 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRE1Q14246 886 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMGCLL1Q8TB92 370 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C3orf30Q96M34 536 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTRCQ9Y297 605 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBXN8O00124 270 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TGM5O43548 720 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABLIM3O94929 683 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLP2RO95838 553 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLTBP09497 229 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH18Q13634 790 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PFKFB4Q16877 469 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCIMPQ6UWF3 145 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRCH3Q96II8 777 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.42■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MROH6A6NGR9 719 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIDE1A8MVS5 230 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NIPSNAP2O75323 286 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSRP3P50461 194 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMD7P51665 324 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ECT2LQ008S8 904 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VEPH1Q14D04 833 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 REP15Q6BDI9 236 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL35Q6PF15 583 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NR5A2O00482 541 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH4P55283 916 aa15.41■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.4 ms