RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484179.5

USP34-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 927 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-215	ENST00000484179	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	PLD1	Q13393	1074 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	CBFB	Q13951	182 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TRIM29	Q14134	588 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	FGF14	Q92915	247 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	EVPL	Q92817	2033 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	SYN3	O14994	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	SLC37A4	O43826	429 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	B3GAT3	O94766	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	ACP5	P13686	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	ENG	P17813	658 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	PSMC3	P17980	439 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	HOXA6	P31267	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	ABCD1	P33897	745 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	OR1D2	P34982	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	KRT2	P35908	639 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	CXCL12	P48061	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TLE3	Q04726	772 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	CAPS	Q13938	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	CALCRL	Q16602	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179		Q6ZNX1	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	FZD8	Q9H461	694 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP34-215	ENST00000484179	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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