RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 OR4L1Q8NH43 312 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CFAP36Q96G28 342 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PDXPQ96GD0 296 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 COX14Q96I36 57 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 VPS35Q96QK1 796 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 EDEM2Q9BV94 578 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 OR2AG1Q9H205 316 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 IL21RQ9HBE5 538 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 KLQ9UEF7 1012 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 KLF15Q9UIH9 416 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 SDC3O75056 442 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 USP1O94782 785 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 VAPBO95292 243 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CER1O95813 267 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CEACAM5P06731 702 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 POLBP06746 335 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 JUNDP17535 347 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PGAM1P18669 254 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PAMP19021 973 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PSMA3P25788 255 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 AKT1P31749 480 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 GNPDA1P46926 289 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 SRP54P61011 504 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PPARDQ03181 441 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CACNG1Q06432 222 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CRYMQ14894 314 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ALG11Q2TAA5 492 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 GPRC6AQ5T6X5 926 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM135Q86UB9 458 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 SERPINA9Q86WD7 417 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 IFT20Q8IY31 132 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PIANPQ8IYJ0 282 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 UNC5BQ8IZJ1 945 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 RBFAQ8N0V3 343 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 NXPE1Q8N323 547 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 DTX3LQ8TDB6 740 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 NAT14Q8WUY8 206 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 OR1E3Q8WZA6 343 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PEX13Q92968 403 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC39Q96DD0 335 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 FGF22Q9HCT0 170 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 SUFUQ9UMX1 484 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.75□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 PRSS38A1L453 326 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 E7ESA3 106 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 TNFRSF10CO14798 259 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 GDF9O60383 454 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CDK14O94921 469 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 RASGRP1O95267 797 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 TTC4O95801 387 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 TNFP01375 233 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 FUCA1P04066 466 aa8.74□□□□□ -1.01
CASQ1-202ENST00000467691 CSF2P04141 144 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms