RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 FICDQ9BVA6 458 aa7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 CDH7Q9ULB5 785 aa7.63□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 KRT20P35900 424 aa7.63□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 TGM3Q08188 693 aa7.63□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.63□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 CDH19Q9H159 772 aa7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 KLHL31Q9H511 634 aa7.63□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.63□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.63□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 CHID1Q9BWS9 393 aa7.63□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 CEP41Q9BYV8 373 aa7.63□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.63□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 DPPA5A6NC42 116 aa7.62□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 KRT72Q14CN4 511 aa7.62□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 SNX10Q9Y5X0 201 aa7.62□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 ITGA2BP08514 1039 aa7.62□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 COL6A2P12110 1019 aa7.62□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 GRK3P35626 688 aa7.62□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 KCNK10P57789 538 aa7.62□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 DEFB103AP81534 67 aa7.62□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 OVGP1Q12889 678 aa7.62□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PRKAA1Q13131 559 aa7.62□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 SPIDRQ14159 915 aa7.62□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
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