RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 HHEXQ03014 270 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 AP1B1Q10567 949 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPN13Q12923 2485 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 MESDQ14696 234 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC18A3Q16572 532 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ALS2CLQ60I27 953 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKS6Q68DC2 871 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 IL22RA1Q8N6P7 574 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PLD5Q8N7P1 536 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 NCSTNQ92542 709 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF157Q96PX1 679 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CTRCQ99895 268 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 DDA1Q9BW61 102 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ADGRE3Q9BY15 652 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM117AQ9C073 453 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 BRD8Q9H0E9 1235 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2AG1Q9H205 316 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 STARD5Q9NSY2 213 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PDP2Q9P2J9 529 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SHOC2Q9UQ13 582 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 FLNCQ14315 2725 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 A6NCN8 305 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 GRID2O43424 1007 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 AKR1B10O60218 316 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 NUAK1O60285 661 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TPM3P06753 285 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM253P0C7T8 217 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 LIFP15018 202 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ITGB6P18564 788 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CLCA4Q14CN2 919 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PDK1Q15118 436 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF569Q5MCW4 686 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 DCAF12Q5T6F0 453 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 IYDQ6PHW0 289 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 XKR5Q6UX68 686 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 NPNTQ6UXI9 565 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 OR8K1Q8NGG5 319 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC35G2Q8TBE7 412 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 EID2BQ96D98 161 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 AGAP3Q96P47 875 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIB3Q96RU7 358 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 HERPUD2Q9BSE4 406 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA16Q9BXB7 569 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC12A9Q9BXP2 914 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM4Q9C037 500 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 DEF6Q9H4E7 631 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 RMI1Q9H9A7 625 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PRDM8Q9NQV8 689 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ATXN10Q9UBB4 475 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CPNE7Q9UBL6 633 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL3Q9UH77 587 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 LCMT1Q9UIC8 334 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 APOL1O14791 398 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 RAD1O60671 282 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 F3P13726 295 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TNNT1P13805 278 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB15P59190 212 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 DYNLT1P63172 113 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNC4Q03721 635 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PCSK7Q16549 785 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC9A4Q6AI14 798 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CRTC3Q6UUV7 619 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC9B2Q86UD5 537 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 NT5DC3Q86UY8 548 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 BMPERQ8N8U9 685 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR26Q8NDV2 337 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SH3KBP1Q96B97 665 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 RTP4Q96DX8 246 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJC7Q99615 494 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CARD9Q9H257 536 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CLMPQ9H6B4 373 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 KLC4Q9NSK0 619 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms