RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 INSL6Q9Y581 213 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TPST1O60507 370 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GUCY1B2O75343 617 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SBK3P0C264 359 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 NPR3P17342 541 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GSTM2P28161 218 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SERPINB1P30740 379 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 BMPR1AP36894 532 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RABGGTBP53611 331 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SCYL2Q6P3W7 929 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TTC23LQ6PF05 361 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 LAYNQ6UX15 382 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SLC22A16Q86VW1 577 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ZFP90Q8TF47 636 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 FAR2Q96K12 515 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF670Q9BS34 389 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 H0YAE9 185 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 M0QX08 132 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 NRP2O60462 931 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CHRNB1P11230 501 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TSPY1Q01534 308 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CDC20Q12834 499 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 BSPRYQ5W0U4 402 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TRNP1Q6NT89 227 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 LINC00523Q86TU6 105 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 HDAC10Q969S8 669 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 BTN2A3PQ96KV6 586 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 RAD9AQ99638 391 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ZBED2Q9BTP6 218 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MED10Q9BTT4 135 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 FUNDC2Q9BWH2 189 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 F5H423 210 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 B4GAT1O43505 415 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 UGT2B11O75310 529 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 FCGR1AP12314 374 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ELK4P28324 431 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GBE1Q04446 702 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF280DQ6N043 979 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 NEK10Q6ZWH5 1172 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PIGZQ86VD9 579 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 HEATR4Q86WZ0 1026 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ARMC8Q8IUR7 673 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MFSD4AQ8N468 514 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MYRFLQ96LU7 910 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SPG21Q9NZD8 308 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM233B4DJY2 109 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SLC22A1O15245 554 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SNAP29O95721 258 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SOD2P04179 222 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 NTRK1P04629 796 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 NR2C2P49116 596 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MAP3K7CLP57077 242 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CA9Q16790 459 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TRPV3Q8NET8 790 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SPPL2BQ8TCT7 592 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 GMIPQ9P107 970 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 A0A0A0MRY4 1105 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 HHLA1C9JL84 531 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 AURKAO14965 403 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 UBDO15205 165 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 KMOO15229 486 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 TIMM44O43615 452 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 VNN2O95498 520 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 BDNFP23560 247 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CYP2F1P24903 491 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 NR4A2P43354 598 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 SLX4IPQ5VYV7 408 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-205ENST00000436404 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms