RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 MED15Q96RN5 788 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TIMP4Q99727 224 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.38□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 UBE4BO95155 1302 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PTPRJQ12913 1337 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 CLTAP09496 248 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 OSMP13725 252 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 CYP11B2P19099 503 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 CCZ1BP86790 482 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ZBTB16Q05516 673 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PDIA5Q14554 519 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 WSCD1Q658N2 575 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 VASH2Q86V25 355 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 BLIDQ8IZY5 108 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 OR2T3Q8NH03 318 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 TRIP11Q15643 1979 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GVL5 298 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 GALNT17Q6IS24 598 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SHC4Q6S5L8 630 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 NEK8Q86SG6 692 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 MMP21Q8N119 569 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 OR4C6Q8NH72 309 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 KIF18AQ8NI77 898 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA1Q92805 767 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.36□□□□□ -1.39
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