RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC40Q9H9A6 602 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 UGT1A7Q9HAW7 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 UGT1A10Q9HAW8 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 UGT1A8Q9HAW9 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM39Q9HCM9 518 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CLCA2Q9UQC9 943 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 C2orf81A6NN90 581 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ACTN2P35609 894 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC89Q8N998 374 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 GLIS1Q8NBF1 620 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 OR4K2Q8NGD2 314 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 GDAP1Q8TB36 358 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 BRSK1Q8TDC3 778 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC74AQ96AQ1 378 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC3Q9BQI4 270 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ETNK1Q9HBU6 452 aa24.75■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR39O43194 453 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 PSMD3O43242 534 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 GRID2O43424 1007 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 NUAK1O60285 661 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNJ1P48048 391 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 TMPRSS15P98073 1019 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 C14orf28Q4W4Y0 310 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 MS4A14Q96JA4 679 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 RMI1Q9H9A7 625 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ARNT2Q9HBZ2 717 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 RABGEF1Q9UJ41 708 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 TRABD2BA6NFA1 517 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CRTAMO95727 393 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 AP2A1O95782 977 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ACP5P13686 325 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CA5AP35218 305 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 LMAN1P49257 510 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 MAZP56270 477 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CRTC3Q6UUV7 619 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 PATE1Q8WXA2 126 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 FKBPLQ9UIM3 349 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNK6Q9Y257 313 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF215Q9Y6U7 377 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 USP27XA6NNY8 438 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF5CO60282 957 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 PPFIA2O75334 1257 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ECEL1O95672 775 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 PROS1P07225 676 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CAMK2BQ13554 666 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 GSE1Q14687 1217 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CDCP2Q5VXM1 449 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 GSTA5Q7RTV2 222 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 OR13C4Q8NGS5 318 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF398Q8TD17 642 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS35Q96QK1 796 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 RAB6BQ9NRW1 208 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 LRIT1Q9P2V4 623 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.72■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 E7EVH7 732 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CDK14O94921 469 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 FDFT1P37268 417 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CCL7P80098 99 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 LRP8Q14114 963 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 SEPT6Q14141 434 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CERCAMQ5T4B2 595 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 NAGSQ8N159 534 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 ARL14Q8N4G2 192 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 OR6C4Q8NGE1 309 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 OR52K1Q8NGK4 314 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 PBKQ96KB5 322 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 PAK5Q9P286 719 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 IGF2RP11717 2491 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-202ENST00000425695 CCL22O00626 93 aa24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1-202ENST00000425695 SNX2O60749 519 aa24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1-202ENST00000425695 EML2O95834 649 aa24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1-202ENST00000425695 GLB1P16278 677 aa24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1-202ENST00000425695 BIRC2Q13490 618 aa24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1-202ENST00000425695 PEX6Q13608 980 aa24.7■■□□□ 1.54
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