RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 LDLRP01130 860 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 NCK1P16333 377 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PGFP49763 221 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 APLP1P51693 650 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ARTNQ5T4W7 220 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 KDELC1Q6UW63 502 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D21Q8IYX1 336 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIB2Q92519 343 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM125Q96AQ2 219 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MUS81Q96NY9 551 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 RAD21L1Q9H4I0 556 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ANAPC2Q9UJX6 822 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 IRAK2O43187 625 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 AKR1A1P14550 325 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 GSK3BP49841 420 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 BFSP2Q13515 415 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATS1Q496A3 300 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CXCL17Q6UXB2 119 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 NRBF2Q96F24 287 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ALPK1Q96QP1 1244 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC30A3Q99726 388 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ATAD3AQ9NVI7 634 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 DAPK2Q9UIK4 370 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CDH9Q9ULB4 789 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CPQQ9Y646 472 aa18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD12Q6UB98 2062 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 IGLV3-25P01717 112 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ALBP02768 609 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MT-ND1P03886 318 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SHMT2P34897 504 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXM1Q08050 763 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ITKQ08881 620 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 OXA1LQ15070 435 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 GNASQ5JWF2 1037 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MANEALQ5VSG8 457 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM86AQ8N2M4 240 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 GAD1Q99259 594 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MUC13Q9H3R2 512 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBB1Q9H4B7 451 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 GMIPQ9P107 970 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 BTRCQ9Y297 605 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 Q9Y3F1 56 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD3Q9Y597 815 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1B0GTL3 188 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCB7O75027 752 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 S1PR4O95977 384 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00032P0C843 101 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXC13P31276 330 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 IDUAP35475 653 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 OPRL1P41146 370 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CD86P42081 329 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 IHHQ14623 411 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 RABL3Q5HYI8 236 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 LDLRAP1Q5SW96 308 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBGCP3Q96CW5 907 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF347Q96SE7 839 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MROQ9BYG7 248 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ALG2Q9H553 416 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 NT5MQ9NPB1 228 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 RGS18Q9NS28 235 aa18.22■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC3P53804 2025 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 UBXN8O00124 270 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MATN4O95460 622 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 UMPSP11172 480 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 HGFP14210 728 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 BCL2A1Q16548 175 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PFKFB4Q16877 469 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO48Q5FWF7 155 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 C14orf80Q86SX3 495 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJB14Q8TBM8 379 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 LPPQ93052 612 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM54Q9BYV2 358 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TMLHEQ9NVH6 421 aa18.21■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MIOSQ9NXC5 875 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms