RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 UBE2CO00762 179 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 KCNJ13O60928 360 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 KCNK5O95279 499 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 CDK4P11802 303 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 PRLRP16471 622 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 UGT1A1P22309 533 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 SSTR2P30874 369 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 LMAN1P49257 510 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 PCYT1AP49585 367 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 CLCNKAP51800 687 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 TAS2R38P59533 333 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 TMF1P82094 1093 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 TRAF3Q13114 568 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 WDR73Q6P4I2 378 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC190Q86UF4 302 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 FJX1Q86VR8 437 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 AVL9Q8NBF6 648 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 KCTD6Q8NC69 237 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 APPL2Q8NEU8 664 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 DUSP19Q8WTR2 217 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 WASF1Q92558 559 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 TMCO6Q96DC7 493 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 FCRL4Q96PJ5 515 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM39BQ9GZU3 492 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJC18Q9H819 358 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 C1RLQ9NZP8 487 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 PADI3Q9ULW8 664 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHA7Q9UN72 937 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF148Q9UQR1 794 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1W2PPE2 198 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1W2PR64 198 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 CLEC18AA5D8T8 446 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 A6NL46 340 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 HS3ST1O14792 307 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 KCNN4O15554 427 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 PLPP2O43688 288 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 RFPL2O75678 378 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 OAZ2O95190 189 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 GLUD1P00367 558 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 GH2P01242 217 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 TPOP07202 933 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 SRCP12931 536 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 SCP2P22307 547 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 ITGB8P26012 769 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 CDC25AP30304 524 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 KCNJ4P48050 445 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 GLUD2P49448 558 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 DDR1Q08345 913 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 MVPQ14764 893 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 KYNUQ16719 465 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 SYT16Q17RD7 645 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 MYLK3Q32MK0 819 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 IGSF11Q5DX21 431 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 XKR9Q5GH70 373 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 KCNT1Q5JUK3 1230 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 ERMARDQ5T6L9 678 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 C18orf63Q68DL7 685 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 ADALQ6DHV7 355 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 RGMBQ6NW40 437 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF549Q6P9A3 640 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 BRAT1Q6PJG6 821 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 TPRG1Q6ZUI0 275 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 RASGEF1CQ8N431 466 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 POMGNT2Q8NAT1 580 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 POGLUT1Q8NBL1 392 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 CLEC18CQ8NCF0 446 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 HMGCLL1Q8TB92 370 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 MAGEC3Q8TD91 643 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 MIB2Q96AX9 1013 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 DGAT2Q96PD7 388 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 CSF3RQ99062 836 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 DDOQ99489 341 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 CMKLR1Q99788 373 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms