RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373434.5

RALGPS1-203, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-203ENST00000373434 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 CCDC154A6NI56 674 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 C1RP00736 705 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 PGFP49763 221 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 RELAQ04206 551 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 TRAF2Q12933 501 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 SEMA3AQ14563 771 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 XKR7Q5GH72 579 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 CENPSQ8N2Z9 138 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 FANCEQ9HB96 536 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 PATJQ8NI35 1801 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 HAS3O00219 553 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 SLC22A3O75751 556 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 RPS17P08708 135 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 ELK4P28324 431 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 ECT2LQ008S8 904 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 TUBA3CQ13748 450 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 CRY1Q16526 586 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 BROXQ5VW32 411 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 ANKS6Q68DC2 871 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 SCD5Q86SK9 330 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 RIMKLAQ8IXN7 391 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 ARRDC2Q8TBH0 407 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 PEX13Q92968 403 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 KIAA1191Q96A73 305 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 MUS81Q96NY9 551 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 NANOGQ9H9S0 305 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 SP110Q9HB58 689 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 USP22Q9UPT9 525 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 TIMM22Q9Y584 194 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1-203ENST00000373434 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 SOBPA7XYQ1 873 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 CDH1P12830 882 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 SOX11P35716 441 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 CCR3P51677 355 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 ARSFP54793 590 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 UFM1P61960 85 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 EMX2Q04743 252 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 GRB14Q14449 540 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 UPP1Q16831 310 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 GPR142Q7Z601 462 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 METTL23Q86XA0 190 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 TEX26Q8N6G2 289 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 STAG3L4Q8TBR4 150 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 RAB2BQ8WUD1 216 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 C1orf74Q96LT6 269 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 RNF145Q96MT1 663 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 ZNF599Q96NL3 588 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 C1orf50Q9BV19 199 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 NTN4Q9HB63 628 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 NUDT5Q9UKK9 219 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 RNF112Q9ULX5 631 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 V9GYQ6 96 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 TMEM221A6NGB7 291 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 K7EPI3 171 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 KPNA6O60684 536 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 BCL10O95999 233 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 FUCA1P04066 466 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 SHMT2P34897 504 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 SCNN1GP51170 649 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 ALDH3A2P51648 485 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 DAG1Q14118 895 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 SNX19Q92543 992 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 LPPQ93052 612 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 LRRC3Q9BY71 257 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-203ENST00000373434 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms