RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357052.7

RAB4B-201, Transcript of RAB4B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB4B, Length 1,133 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4B-201ENST00000357052 PDP2Q9P2J9 529 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB4B-201ENST00000357052 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB4B-201ENST00000357052 ZNF487B1APH4 448 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 GRID2O43424 1007 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 AKR1B10O60218 316 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 NUAK1O60285 661 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 FAM87AP0C7U9 286 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 SFTPCP11686 197 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 UGT1A3P35503 534 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ARSDP51689 593 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 RAB15P59190 212 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 AP1B1Q10567 949 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ZBTB17Q13105 803 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 GALNT3Q14435 633 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 DCAF12Q5T6F0 453 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 CNTD1Q8N815 330 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 NCSTNQ92542 709 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 CARD9Q9H257 536 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 HECTD1Q9ULT8 2610 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 A0A0G2JNG1 304 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 A8MU76 341 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 APOL1O14791 398 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 F3P13726 295 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 MAPK9P45984 424 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 TRIM14Q14142 442 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 KIR2DS5Q14953 304 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 PDK1Q15118 436 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ODF2Q5BJF6 829 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ALS2CLQ60I27 953 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 VSIG1Q86XK7 387 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 AVL9Q8NBF6 648 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 EID2BQ96D98 161 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 AGAP3Q96P47 875 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 DNAJC7Q99615 494 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 CEP41Q9BYV8 373 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 OR2AG1Q9H205 316 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 RAD18Q9NS91 495 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 STARD5Q9NSY2 213 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 A6NCN8 305 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 OR5K4A6NMS3 321 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 CBFA2T2O43439 604 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 RAD1O60671 282 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 SLC4A1P02730 911 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 KRT1P04264 644 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 PIRTP0C851 137 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ARHGAP25P42331 645 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 EPHA4P54764 986 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 CDK18Q07002 472 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 PCSK7Q16549 785 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ANKS6Q68DC2 871 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 TRIB3Q96RU7 358 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 KLC4Q9NSK0 619 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 MTA2O94776 668 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 TPM1P09493 284 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 GPR89BP0CG08 455 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 LIFP15018 202 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 ITGB6P18564 788 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 CLCNKAP51800 687 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB4B-201ENST00000357052 DCDC1P59894 354 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms