RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 TCF7L2Q9NQB0 619 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R1Q9NYW7 299 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CDH22Q9UJ99 828 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 APPL1Q9UKG1 709 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD12Q6UB98 2062 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 LRRC14BA6NHZ5 514 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 B2RBV5 119 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 E5RI56 91 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SLCO1B7G3V0H7 640 aa17.75■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 ADH5P11766 374 aa17.75■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 LHCGRP22888 699 aa17.75■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 WASH3PC4AMC7 463 aa17.74■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 GSC2O15499 205 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SUPT7LO94864 414 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ATP6V1G2O95670 118 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ARSAP15289 507 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ITGALP20701 1170 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 DGKGP49619 791 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CLCN7P51798 805 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ATP6V0D1P61421 351 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 HERVK_113P63132 956 aa17.74■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 USP45Q70EL2 814 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 NPAS3Q8IXF0 933 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CPNE9Q8IYJ1 553 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 TEX9Q8N6V9 391 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 KCNJ9Q92806 393 aa17.74■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 C19orf43Q9BQ61 176 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ERVK-6Q9BXR3 956 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CIPCQ9C0C6 399 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 IGFLR1Q9H665 355 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SUPT3HB4E1H0 165 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 KERAO60938 352 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SUPT3HO75486 399 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ECI2O75521 394 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ITGB6P18564 788 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 IL2P60568 153 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 POU5F2Q8N7G0 328 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 HEPHQ9BQS7 1158 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PBX4Q9BYU1 374 aa17.74■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 SFXN1Q9H9B4 322 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 B4GALT6Q9UBX8 382 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CRLS1Q9UJA2 301 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 WASF2Q9Y6W5 498 aa17.74■□□□□ 0.43
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ACTB-201ENST00000331789 DCXO43602 365 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ACRV1P26436 265 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SLC6A11P48066 632 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CDH13P55290 713 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 MESP2Q0VG99 397 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 KCNC3Q14003 757 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ARSIQ5FYB1 569 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PLPP6Q8IY26 295 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ZNF366Q8N895 744 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 EBF3Q9H4W6 596 aa17.73■□□□□ 0.43
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