RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302313.9

WDR48-201, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene WDR48, Length 3,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-201ENST00000302313 IRF9Q00978 393 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 PSMD5Q16401 504 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 FAM182AQ5T1J6 154 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 FAM45BPQ6NSW5 357 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 TNS4Q8IZW8 715 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 KDM1BQ8NB78 822 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 FAM45AQ8TCE6 357 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 NRCAMQ92823 1304 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 IFT22Q9H7X7 185 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 USP22Q9UPT9 525 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 LEUTXA8MZ59 168 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 CCRL2O00421 344 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 PIK3R2O00459 728 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 MTSS1O43312 755 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 PTTG1O95997 202 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 CHRNGP07510 517 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ACADMP11310 421 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 GOT1P17174 413 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 MAGEA11P43364 429 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 GRIA4P48058 902 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ETV1P50549 477 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 AIF1P55008 147 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ARHGAP1Q07960 439 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ESCO2Q56NI9 601 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 TAPT1Q6NXT6 567 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 CASC4Q6P4E1 433 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 BEND5Q7L4P6 421 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 LGI2Q8N0V4 545 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 HDAC11Q96DB2 347 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 PDXPQ96GD0 296 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 UROC1Q96N76 676 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 GPR78Q96P69 363 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 IL12RB2Q99665 862 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 CD320Q9NPF0 282 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 C8orf4Q9NR00 106 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 SDHDO14521 159 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 CACNG3O60359 315 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 PIGNO95427 931 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 BMP4P12644 408 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ARL4AP40617 200 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ATP4BP51164 291 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 SQLEQ14534 574 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 SNX17Q15036 470 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 GPR107Q5VW38 600 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 RANBP10Q6VN20 620 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 SNX19Q92543 992 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 HSFY1Q96LI6 401 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 LGMNQ99538 433 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 KIFC1Q9BW19 673 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 DPP3Q9NY33 737 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 ZNF639Q9UID6 485 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-201ENST00000302313 MCM3APO60318 1980 aa7.15□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 GBF1Q92538 1859 aa7.15□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PATJQ8NI35 1801 aa7.15□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ZBBXA8MT70 800 aa7.15□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 DDHD2O94830 711 aa7.15□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.15□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.15□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MATKP42679 507 aa7.15□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 RGS7P49802 495 aa7.15□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SEMA3BQ13214 749 aa7.15□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 IRF5Q13568 498 aa7.15□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms