RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 AGAP14A8MT82 685 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 NUAK1O60285 661 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 MTX2O75431 263 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ASMTLO95671 621 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 KRT14P02533 472 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 AK4P27144 223 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CTBSQ01459 385 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CDH17Q12864 832 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 POU6F1Q14863 301 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 OGFOD3Q6PK18 319 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 GKN2Q86XP6 184 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 E7EVH7 732 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CCL22O00626 93 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA6P43360 314 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 FNTAP49354 379 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ZNF534Q76KX8 674 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 TAF8Q7Z7C8 310 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ZNF398Q8TD17 642 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 OR2AG1Q9H205 316 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 PTPRBP23467 1997 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CHUKO15111 745 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS15P98073 1019 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 PDE1BQ01064 536 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ11Q14654 390 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 OR2M4Q96R27 311 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 RMI1Q9H9A7 625 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 SMOXQ9NWM0 555 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 GPR34Q9UPC5 381 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 RP1P56715 2156 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 H7C0S8 307 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 NOBOXO60393 691 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 TPSB2P20231 275 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 PTGIRP43119 386 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 LMAN1P49257 510 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 VPS41P49754 854 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 GPS1Q13098 491 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 TPSAB1Q15661 275 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CCDC38Q502W7 563 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 GPR156Q8NFN8 814 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 STYXQ8WUJ0 223 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ZNF778Q96MU6 729 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 RANBP9Q96S59 729 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 APPL1Q9UKG1 709 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 GRID2O43424 1007 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 RFPL3O75679 317 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 TRIM16O95361 564 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF1O95521 474 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ARSDP51689 593 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 FOXC1Q12948 553 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 NFATC2Q13469 925 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ITGA9Q13797 1035 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 HS1BP3Q53T59 392 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 GPRC6AQ5T6X5 926 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 GUSBP11Q6P575 273 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 GALNT13Q8IUC8 556 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 KYQ8NBH2 561 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 FAM46DQ8NEK8 389 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CPT1BQ92523 772 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 SLCO2A1Q92959 643 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 GSDMCQ9BYG8 508 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 TAAR2Q9P1P5 351 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 SLC23A2Q9UGH3 650 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 PRR19A6NJB7 356 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 VEGFDO43915 354 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CDK14O94921 469 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms