RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 CYBRD1Q53TN4 286 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 PM20D1Q6GTS8 502 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKRD46Q86W74 232 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 PGBD5Q8N414 524 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 OR2T11Q8NH01 316 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 CDC26Q8NHZ8 85 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 TANKQ92844 425 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 GLT1D1Q96MS3 346 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 BEGAINQ9BUH8 593 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 C9orf16Q9BUW7 83 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 NANOGQ9H9S0 305 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa17.25■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 DOCK3Q8IZD9 2030 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ARVCFO00192 962 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 TLR5O60602 858 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 HMOX2P30519 316 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ADRA1AP35348 466 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 GTDC1Q4AE62 458 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ENPP6Q6UWR7 440 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 LZTR1Q8N653 840 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 OR4K2Q8NGD2 314 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 OR6K2Q8NGY2 324 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 TBC1D15Q8TC07 691 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 TMBIM1Q969X1 311 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC9A7Q96T83 725 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 IL12RB2Q99665 862 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 APOL5Q9BWW9 433 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 LHPPQ9H008 270 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 VTA1Q9NP79 307 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 MYADML2A6NDP7 307 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 GABRDO14764 452 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 GSTA4O15217 222 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ECI2O75521 394 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 BCL10O95999 233 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 RPL34P49207 117 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 CLCN5P51795 746 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ADRM1Q16186 407 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 OVOS1Q6IE37 1185 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 IL27RAQ6UWB1 636 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 SYVN1Q86TM6 617 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 TRPV3Q8NET8 790 aa17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 SH3PXD2BA1X283 911 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ASPDHA6ND91 283 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ACOX3O15254 700 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 SNX2O60749 519 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 BMP2P12643 396 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 MTHFD2P13995 350 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 OR1E1P30953 314 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 CD52P31358 61 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 PBX3P40426 434 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 PSEN2P49810 448 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 CCT8P50990 548 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 PTGR1Q14914 329 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 BBS5Q8N3I7 341 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPAN17Q96FV3 270 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 RHNO1Q9BSD3 238 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ZBED2Q9BTP6 218 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 HIPK3Q9H422 1215 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 GID8Q9NWU2 228 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 FLRT1Q9NZU1 646 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 KRT87PA6NCN2 255 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 BNIP3LO60238 219 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 HS6ST1O60243 411 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 SCNN1AP37088 669 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 CAPGP40121 348 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 SCAPQ12770 1279 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF235Q14590 738 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 NR6A1Q15406 480 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 SCD5Q86SK9 330 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC22A9Q8IVM8 553 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 GPC2Q8N158 579 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKFN1Q8N957 763 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 OR7D4Q8NG98 312 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 OR10A6Q8NH74 314 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 FRS2Q8WU20 508 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 UBXN10Q96LJ8 280 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 NSMCE2Q96MF7 247 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ITM2CQ9NQX7 267 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 NOD1Q9Y239 953 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 CXCL11O14625 94 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR182O15218 404 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 CYBBP04839 570 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 LHX1P48742 406 aa17.23■□□□□ 0.35
KCNQ1-201ENST00000155840 HMGCS1Q01581 520 aa17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms